162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0712 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  100 
 
 		 496 aa  974    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  59.56 
 
 		 499 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  59.25 
 
 		 518 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  52.84 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  53.03 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  33 
 
 		 516 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  40.91 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  40.8 
 
 		 383 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  32.01 
 
 		 507 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  34.9 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  39.39 
 
 		 513 aa  189  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  32.55 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  33.18 
 
 		 507 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  32.43 
 
 		 519 aa  179  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.65 
 
 		 526 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  32.65 
 
 		 524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  32.65 
 
 		 524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.65 
 
 		 526 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  32.65 
 
 		 524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  32.65 
 
 		 526 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.65 
 
 		 524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  31.01 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  32.43 
 
 		 524 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  30.08 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  34.11 
 
 		 492 aa  170  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  31.75 
 
 		 524 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  31.75 
 
 		 524 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  35.48 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  29.61 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  33.2 
 
 		 491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  32.31 
 
 		 537 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  35.05 
 
 		 490 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  27.37 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  30.77 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  29.61 
 
 		 473 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  29.81 
 
 		 477 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  29.88 
 
 		 446 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  29.68 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  31.86 
 
 		 472 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  30.84 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  26.57 
 
 		 460 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  27.81 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  27.81 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  28.19 
 
 		 538 aa  101  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  28.04 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  28.87 
 
 		 430 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  29.82 
 
 		 467 aa  96.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  27.63 
 
 		 423 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  26.42 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  27.3 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  27.3 
 
 		 421 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  26.18 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  27.25 
 
 		 500 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  25.52 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  27.84 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  24.81 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  25 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  24.87 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  24.87 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  24.91 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  24.55 
 
 		 553 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  24.55 
 
 		 549 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  24.55 
 
 		 553 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.29 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.73 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  28.84 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.84 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  27.37 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  27.32 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  25.13 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  26.8 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.42 
 
 		 257 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.84 
 
 		 257 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  26.84 
 
 		 257 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  26.42 
 
 		 257 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  26.42 
 
 		 257 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  26.84 
 
 		 257 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.26 
 
 		 252 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  24.74 
 
 		 252 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  26.32 
 
 		 257 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  25.24 
 
 		 559 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  25.39 
 
 		 252 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  25.39 
 
 		 252 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  25.12 
 
 		 261 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  25.91 
 
 		 249 aa  53.9  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  25.24 
 
 		 559 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  35.4 
 
 		 646 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  25.05 
 
 		 559 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  22.84 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  22.75 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  26.46 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  22.84 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  25.24 
 
 		 559 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 270 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  25.28 
 
 		 386 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  26.46 
 
 		 260 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  24.04 
 
 		 315 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  25.05 
 
 		 559 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>