98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0445 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  100 
 
 
538 aa  1049    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  43.07 
 
 
451 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  34.75 
 
 
430 aa  259  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  44.13 
 
 
460 aa  253  8.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  44.34 
 
 
446 aa  249  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  41.41 
 
 
450 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  41.41 
 
 
450 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  48.16 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  45.53 
 
 
473 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  43.14 
 
 
422 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  40.06 
 
 
421 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  40.06 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  46.79 
 
 
423 aa  213  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  38.21 
 
 
430 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  49.52 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  33.55 
 
 
537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  34.58 
 
 
477 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  28.55 
 
 
507 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  28.27 
 
 
507 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  28.17 
 
 
507 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  30.81 
 
 
516 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  26.4 
 
 
495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  25.97 
 
 
519 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  31.73 
 
 
467 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  27.71 
 
 
504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  36.7 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  25.85 
 
 
519 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  29.39 
 
 
500 aa  139  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  25.69 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  34.26 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  25.69 
 
 
526 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.69 
 
 
524 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  27.13 
 
 
475 aa  135  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  25.69 
 
 
524 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  25.69 
 
 
524 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  25.75 
 
 
524 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  25.69 
 
 
524 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.49 
 
 
526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  25.49 
 
 
524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.49 
 
 
526 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  27.56 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  29.09 
 
 
513 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  31.88 
 
 
518 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  26.01 
 
 
468 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  28.63 
 
 
492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  25.57 
 
 
489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  28.77 
 
 
490 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  29.73 
 
 
477 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  30.44 
 
 
482 aa  105  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  29.28 
 
 
496 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  29.08 
 
 
499 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  26.07 
 
 
509 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  29.4 
 
 
491 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  29.5 
 
 
480 aa  97.4  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  28.83 
 
 
503 aa  93.6  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  27.46 
 
 
383 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  25.99 
 
 
370 aa  87.8  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  28.95 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  25.44 
 
 
744 aa  77.4  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06177  flotillin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08180)  27.96 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.226938  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  25.75 
 
 
562 aa  54.3  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  25 
 
 
560 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  21.98 
 
 
361 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  23.21 
 
 
256 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.88 
 
 
311 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.88 
 
 
311 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.88 
 
 
311 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  21.76 
 
 
319 aa  47  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1357  protease  26.87 
 
 
307 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.605362  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1616  SPFH domain-containing protein  23.1 
 
 
477 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  23.36 
 
 
604 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  22.78 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1064  band 7 protein  23.11 
 
 
308 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  24.55 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  26.19 
 
 
560 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.42 
 
 
311 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  23.16 
 
 
260 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  21.93 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  23.13 
 
 
592 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  23.13 
 
 
592 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  23.13 
 
 
592 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  24.19 
 
 
308 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  23.13 
 
 
592 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  22.03 
 
 
549 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  23.08 
 
 
263 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  22.08 
 
 
553 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  22.99 
 
 
305 aa  44.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  22.08 
 
 
553 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.08 
 
 
553 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.03 
 
 
553 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  24.29 
 
 
257 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  22.99 
 
 
305 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  24.29 
 
 
257 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  22.48 
 
 
314 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.07 
 
 
257 aa  43.9  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  23.66 
 
 
672 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  22.46 
 
 
542 aa  43.5  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  21.74 
 
 
553 aa  43.5  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>