93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2104 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  100 
 
 		 513 aa  985    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  48.38 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  44.31 
 
 		 516 aa  349  8e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  36.06 
 
 		 495 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  37.19 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  38.59 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  34.88 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  36.29 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  38.43 
 
 		 490 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  40.5 
 
 		 491 aa  236  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  39.29 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  35.1 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  34.98 
 
 		 524 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  35.32 
 
 		 526 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.32 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.52 
 
 		 526 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  35.32 
 
 		 524 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  35.32 
 
 		 524 aa  224  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.52 
 
 		 526 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  35.32 
 
 		 524 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  35.32 
 
 		 524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  35.32 
 
 		 524 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  35.26 
 
 		 518 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  31.12 
 
 		 475 aa  206  8e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  34.35 
 
 		 499 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  33 
 
 		 537 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  34.97 
 
 		 477 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  34.97 
 
 		 480 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  31.26 
 
 		 499 aa  167  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  31.7 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  29.98 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  27.09 
 
 		 489 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  30.57 
 
 		 538 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  37.33 
 
 		 370 aa  156  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  31.5 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  31.99 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  29.96 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  30.15 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  30.15 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  32.13 
 
 		 430 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  37.04 
 
 		 473 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  34.89 
 
 		 446 aa  139  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  31.95 
 
 		 451 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  34.93 
 
 		 430 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  31.46 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  33.04 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  36.75 
 
 		 414 aa  133  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  29.3 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  29.08 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  33.47 
 
 		 447 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  30.81 
 
 		 500 aa  126  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  31.16 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  31.16 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  29.9 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  30.35 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  27.03 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  26.74 
 
 		 504 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  27.13 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  24.31 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  24.19 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  23.14 
 
 		 587 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  24.1 
 
 		 553 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  23.54 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  23.54 
 
 		 549 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1616  SPFH domain-containing protein  23.39 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  23.54 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.1 
 
 		 553 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  23.9 
 
 		 553 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.73 
 
 		 553 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  23.43 
 
 		 542 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  23.63 
 
 		 560 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  25 
 
 		 570 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  27.86 
 
 		 646 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  23.38 
 
 		 559 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  20.81 
 
 		 592 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  20.81 
 
 		 592 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  26.05 
 
 		 568 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  20.81 
 
 		 592 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  23.01 
 
 		 559 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  20.81 
 
 		 592 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  23.01 
 
 		 559 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  23.01 
 
 		 559 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  23.01 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  24.72 
 
 		 542 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.49 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  24.49 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  19.59 
 
 		 589 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  22.78 
 
 		 590 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  23.6 
 
 		 681 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  24.26 
 
 		 562 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.46 
 
 		 257 aa  43.9  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06177  flotillin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08180)  21.26 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.226938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  20.83 
 
 		 569 aa  43.5  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>