142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1727 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  100 
 
 		 472 aa  921    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  44.49 
 
 		 477 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  43.19 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  35.56 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  31.88 
 
 		 475 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  36.55 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  35.91 
 
 		 507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  34.91 
 
 		 519 aa  196  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.43 
 
 		 524 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.43 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  34.43 
 
 		 524 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  34.43 
 
 		 524 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.43 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  34.43 
 
 		 524 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  34.43 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  34.2 
 
 		 524 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  33.73 
 
 		 524 aa  192  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  33.49 
 
 		 524 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  34.45 
 
 		 537 aa  181  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  30.1 
 
 		 538 aa  146  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  26.88 
 
 		 507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  28.62 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  28.62 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  29.57 
 
 		 516 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  26.9 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  31.8 
 
 		 496 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  31.96 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  27.49 
 
 		 509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  30.13 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  28.18 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  29.14 
 
 		 423 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  25.44 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  25.89 
 
 		 504 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  26.97 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  25.88 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  28.67 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  28.67 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  29.15 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  26.55 
 
 		 473 aa  123  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  27.84 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  31.34 
 
 		 518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  28.9 
 
 		 446 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  26.65 
 
 		 473 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  29.96 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  30.16 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  25.4 
 
 		 519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  27.54 
 
 		 482 aa  103  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  30.61 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  27.46 
 
 		 459 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  30 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  29.55 
 
 		 490 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  30.59 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  30.46 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  31.46 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  28.67 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  28.86 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  29.32 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  25.05 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  24.95 
 
 		 553 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  24.9 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  25.1 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  24.9 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  24.9 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.12 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  26.3 
 
 		 964 aa  60.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  28.69 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  24.62 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  24.8 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  24.85 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  24.8 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  23.6 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  24.84 
 
 		 604 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.41 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  24 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  23.4 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  24.3 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  22.46 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  24.41 
 
 		 542 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  24.8 
 
 		 559 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  24.85 
 
 		 559 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  22.8 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  26.98 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  26.98 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  26.98 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  25.27 
 
 		 559 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  24.59 
 
 		 559 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06177  flotillin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08180)  26.53 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.226938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  25.27 
 
 		 559 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1074  band 7 protein  25.68 
 
 		 282 aa  54.3  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.89 
 
 		 345 aa  53.9  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  22 
 
 		 380 aa  53.5  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  20.94 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  23.15 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  25.75 
 
 		 558 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06901  Band 7 protein  26.75 
 
 		 304 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.38 
 
 		 305 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  23.48 
 
 		 568 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  23.06 
 
 		 592 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  22.22 
 
 		 595 aa  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>