65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0402 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  100 
 
 
473 aa  944    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  48.16 
 
 
451 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  47 
 
 
460 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  47.46 
 
 
447 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  48.07 
 
 
446 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  44.36 
 
 
450 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  44.36 
 
 
450 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  43.13 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  38.74 
 
 
423 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  36.59 
 
 
422 aa  263  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  36.66 
 
 
421 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  36.66 
 
 
421 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  36.39 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  38.54 
 
 
414 aa  246  9e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  41.81 
 
 
538 aa  222  9e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  31.35 
 
 
477 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  29.66 
 
 
473 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  34.4 
 
 
537 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  31.3 
 
 
467 aa  133  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  26.19 
 
 
495 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  33.19 
 
 
507 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  33.58 
 
 
507 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  29.77 
 
 
496 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  29.47 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  29.41 
 
 
500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  31.4 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.4 
 
 
526 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.4 
 
 
526 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.4 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  31.4 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  31.4 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  31.4 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  31.4 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  31.4 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  33.33 
 
 
516 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  31.4 
 
 
524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  32.75 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  30.99 
 
 
524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  30.41 
 
 
504 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  28.11 
 
 
477 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  31.51 
 
 
475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  29.31 
 
 
518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  37.31 
 
 
492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  24.01 
 
 
507 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  33.65 
 
 
480 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  31.64 
 
 
503 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  31.05 
 
 
490 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  27.9 
 
 
468 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  30.03 
 
 
482 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  23.54 
 
 
489 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  28.44 
 
 
519 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  26.67 
 
 
499 aa  93.6  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  29.48 
 
 
509 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  30.07 
 
 
499 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  27.3 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  25.9 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  31.07 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  28.19 
 
 
562 aa  50.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  30.59 
 
 
560 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  23.95 
 
 
601 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  23.95 
 
 
601 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  28.68 
 
 
560 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  22.62 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  22.19 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0546  band 7 protein  22.29 
 
 
321 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.141475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>