66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2459 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  100 
 
 
601 aa  1199    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  99.67 
 
 
601 aa  1193    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  27.2 
 
 
672 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  27.37 
 
 
693 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  27.04 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  26.94 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  26.94 
 
 
553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  26.94 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  27.24 
 
 
553 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.23 
 
 
553 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.02 
 
 
553 aa  120  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  27.91 
 
 
585 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  29.03 
 
 
587 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  27.15 
 
 
542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  27.03 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  27.21 
 
 
559 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  27.21 
 
 
559 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  27.21 
 
 
559 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  27.21 
 
 
559 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  27.21 
 
 
559 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  28.4 
 
 
568 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  25.35 
 
 
587 aa  104  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  26.8 
 
 
589 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  24.66 
 
 
592 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  24.66 
 
 
592 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  24.66 
 
 
592 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  26.64 
 
 
592 aa  98.2  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  24.31 
 
 
592 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  24.31 
 
 
592 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  24.31 
 
 
592 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  24.29 
 
 
569 aa  94.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  24.38 
 
 
604 aa  94.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  23.68 
 
 
592 aa  94  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  24.08 
 
 
585 aa  90.5  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  23.87 
 
 
590 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  28.5 
 
 
744 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  26.3 
 
 
562 aa  88.2  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  22.81 
 
 
595 aa  87.8  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  23.39 
 
 
560 aa  87  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  24.64 
 
 
570 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  22.22 
 
 
542 aa  72  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  21.78 
 
 
560 aa  71.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  23.7 
 
 
964 aa  66.6  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  26.4 
 
 
475 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  24.94 
 
 
489 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  23.95 
 
 
509 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  23.01 
 
 
667 aa  59.3  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  22.93 
 
 
468 aa  58.9  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  22.89 
 
 
499 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  22.47 
 
 
691 aa  51.2  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  22.48 
 
 
477 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  23.7 
 
 
507 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  20.5 
 
 
519 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  22.98 
 
 
681 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  24.44 
 
 
537 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  22.29 
 
 
712 aa  47.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  22.19 
 
 
700 aa  47.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  22.99 
 
 
477 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  24.17 
 
 
460 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  22.66 
 
 
679 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  23.53 
 
 
496 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  25.48 
 
 
473 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  22.27 
 
 
518 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  24.09 
 
 
688 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  24.15 
 
 
688 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  23.68 
 
 
507 aa  43.9  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>