60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_16180 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  88.61 
 
 		 681 aa  1133    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  98.4 
 
 		 688 aa  1324    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  64.41 
 
 		 644 aa  801    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  54.55 
 
 		 667 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  74.59 
 
 		 691 aa  976    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  63.65 
 
 		 672 aa  794    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  100 
 
 		 688 aa  1339    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  49 
 
 		 700 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  49.4 
 
 		 712 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  49.39 
 
 		 748 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  46.25 
 
 		 668 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  46.54 
 
 		 679 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  34.25 
 
 		 695 aa  289  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  29.47 
 
 		 585 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  29.93 
 
 		 587 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  28.95 
 
 		 558 aa  152  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  30.08 
 
 		 569 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  32.66 
 
 		 568 aa  150  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  27.61 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  28.14 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  27.83 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  28.14 
 
 		 549 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.23 
 
 		 553 aa  145  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  27.83 
 
 		 592 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  28.14 
 
 		 553 aa  145  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  29.25 
 
 		 562 aa  144  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  28.14 
 
 		 553 aa  145  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  28.14 
 
 		 553 aa  145  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.66 
 
 		 553 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  27.31 
 
 		 592 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  27.31 
 
 		 592 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  28.02 
 
 		 585 aa  144  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  27.31 
 
 		 592 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  27.31 
 
 		 592 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  29.01 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  27.25 
 
 		 592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  28.79 
 
 		 570 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  28.7 
 
 		 744 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  29.95 
 
 		 560 aa  138  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  26.54 
 
 		 604 aa  138  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  25.93 
 
 		 587 aa  138  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  27.39 
 
 		 590 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  26.25 
 
 		 595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  30.34 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  27.87 
 
 		 589 aa  134  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  30.11 
 
 		 559 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  30.11 
 
 		 559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  30.11 
 
 		 559 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  30.11 
 
 		 559 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  28.57 
 
 		 560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  30.82 
 
 		 964 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  25.81 
 
 		 693 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  25.71 
 
 		 672 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  23.75 
 
 		 542 aa  97.8  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  22.65 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  22.36 
 
 		 601 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  24.85 
 
 		 477 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  21.51 
 
 		 475 aa  45.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.35 
 
 		 557 aa  44.3  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  23.33 
 
 		 507 aa  43.9  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>