96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3554 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  93.03 
 
 
553 aa  982    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  94.01 
 
 
542 aa  967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  93.76 
 
 
553 aa  975    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  93.21 
 
 
553 aa  989    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  99.82 
 
 
559 aa  1104    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  99.64 
 
 
559 aa  1102    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  99.28 
 
 
559 aa  1099    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  93.21 
 
 
553 aa  986    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  99.64 
 
 
559 aa  1103    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  100 
 
 
559 aa  1106    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  93.03 
 
 
553 aa  982    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  93.21 
 
 
553 aa  989    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  93.21 
 
 
549 aa  989    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  58.91 
 
 
558 aa  586  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  51.64 
 
 
570 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  48.28 
 
 
569 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  46.86 
 
 
604 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  46.07 
 
 
592 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  45.45 
 
 
592 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  45.66 
 
 
592 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  45.66 
 
 
592 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  45.45 
 
 
592 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  45.66 
 
 
592 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  45.66 
 
 
592 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  46.07 
 
 
590 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  46.68 
 
 
585 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  45.31 
 
 
587 aa  428  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  44.68 
 
 
592 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  45.52 
 
 
589 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  46.42 
 
 
595 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  43.91 
 
 
562 aa  365  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  43.46 
 
 
568 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  43.01 
 
 
585 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  41.46 
 
 
560 aa  350  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  42.49 
 
 
587 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  38.92 
 
 
560 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  44.59 
 
 
964 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  32.47 
 
 
542 aa  219  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  31.21 
 
 
672 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  30.28 
 
 
744 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  29.78 
 
 
693 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  29.85 
 
 
644 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  27.96 
 
 
691 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  29.95 
 
 
688 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  30.02 
 
 
688 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  29.39 
 
 
667 aa  143  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  29.14 
 
 
668 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  29.56 
 
 
712 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  31.01 
 
 
700 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  27.92 
 
 
681 aa  136  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  28.23 
 
 
672 aa  128  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  28.25 
 
 
748 aa  123  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  28.08 
 
 
679 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  26.36 
 
 
601 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  26.36 
 
 
601 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.63 
 
 
524 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  28.63 
 
 
526 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.63 
 
 
526 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  28.63 
 
 
524 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.63 
 
 
526 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  28.63 
 
 
524 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  28.63 
 
 
524 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  28.63 
 
 
524 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  25.24 
 
 
507 aa  99.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  28.43 
 
 
524 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  25.54 
 
 
495 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  28.12 
 
 
519 aa  98.2  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  25 
 
 
475 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  28.22 
 
 
524 aa  94  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  26.71 
 
 
507 aa  87.4  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  24.65 
 
 
504 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  26.73 
 
 
507 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  24.45 
 
 
695 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  27.23 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  23.49 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  24.07 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  24.24 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  24.05 
 
 
509 aa  67.8  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  24.72 
 
 
537 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  25.14 
 
 
467 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  23.85 
 
 
519 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  22.85 
 
 
477 aa  60.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  22.66 
 
 
490 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  25.15 
 
 
492 aa  57.4  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  25.39 
 
 
496 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  26.3 
 
 
503 aa  52.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  24.9 
 
 
472 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  24.56 
 
 
383 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  23.2 
 
 
491 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  25.76 
 
 
1682 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  23.16 
 
 
499 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  23.21 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  21.23 
 
 
513 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  21.6 
 
 
459 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  22.28 
 
 
450 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  22.28 
 
 
450 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>