100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4673 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  71.29 
 
 		 562 aa  674    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  65.41 
 
 		 560 aa  658    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  100 
 
 		 560 aa  1088    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  46.86 
 
 		 592 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  46.86 
 
 		 592 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  46.86 
 
 		 592 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  46.94 
 
 		 592 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  46.86 
 
 		 592 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  46.78 
 
 		 590 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  45.86 
 
 		 604 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  45 
 
 		 592 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  44.5 
 
 		 587 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  45.73 
 
 		 592 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  47.27 
 
 		 592 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  43.49 
 
 		 589 aa  391  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  47.38 
 
 		 585 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  46.49 
 
 		 595 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  42.53 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  45.68 
 
 		 569 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  40.87 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  40.54 
 
 		 553 aa  359  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  40.54 
 
 		 553 aa  359  6e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  40.69 
 
 		 549 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.29 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  41.04 
 
 		 553 aa  356  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  40.93 
 
 		 542 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.29 
 
 		 553 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  41.93 
 
 		 585 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  41.51 
 
 		 570 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  40.81 
 
 		 559 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  40.89 
 
 		 559 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  40.62 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  40.62 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  40.71 
 
 		 559 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  43.78 
 
 		 587 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  36.36 
 
 		 542 aa  328  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  45.55 
 
 		 568 aa  316  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  44.17 
 
 		 964 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  30.3 
 
 		 744 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  29.06 
 
 		 693 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  28.6 
 
 		 691 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  27.27 
 
 		 672 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  29.05 
 
 		 688 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  29.05 
 
 		 688 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  29.75 
 
 		 644 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  28.47 
 
 		 672 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  27.65 
 
 		 681 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  33.25 
 
 		 679 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  27.18 
 
 		 667 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  29.85 
 
 		 712 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  29.9 
 
 		 668 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  28.19 
 
 		 700 aa  123  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  30.75 
 
 		 748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  23.97 
 
 		 601 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  23.97 
 
 		 601 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  26.42 
 
 		 475 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  25.55 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  26.21 
 
 		 504 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  28.78 
 
 		 507 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  28.63 
 
 		 507 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  25.86 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  27.32 
 
 		 695 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  29.98 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.74 
 
 		 524 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  27.74 
 
 		 526 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.74 
 
 		 526 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  27.74 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.74 
 
 		 526 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  27.74 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  27.74 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  28.46 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  27.1 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  28.05 
 
 		 524 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  26.03 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  23.28 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  28.69 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  23.36 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  23.95 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  27.01 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  28.87 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  25.27 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  26.86 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  26.12 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  25.37 
 
 		 509 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  27.52 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  23.86 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  27.15 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  22.05 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  25.49 
 
 		 450 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  25.49 
 
 		 450 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  23.94 
 
 		 489 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  23.6 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  22.67 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  25.07 
 
 		 430 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  24.37 
 
 		 538 aa  51.6  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  23.24 
 
 		 513 aa  50.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  23.41 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  24.09 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  23.87 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  25.53 
 
 		 499 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>