186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0782 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  100 
 
 
503 aa  985    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  44.68 
 
 
507 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  42.89 
 
 
507 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  42.34 
 
 
495 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.73 
 
 
524 aa  286  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.73 
 
 
526 aa  286  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  37.73 
 
 
524 aa  286  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  37.73 
 
 
524 aa  286  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.73 
 
 
526 aa  286  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  37.73 
 
 
524 aa  286  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  37.73 
 
 
526 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  37.32 
 
 
519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  37.53 
 
 
524 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  36.71 
 
 
524 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  36.92 
 
 
524 aa  281  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  38.15 
 
 
537 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  36.02 
 
 
475 aa  237  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  36.19 
 
 
509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  33.71 
 
 
489 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  33.26 
 
 
499 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  29.86 
 
 
468 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  32.02 
 
 
518 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  33.7 
 
 
496 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  32.14 
 
 
492 aa  156  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  29.05 
 
 
477 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  30.82 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  29.67 
 
 
467 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  32.22 
 
 
513 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  32.2 
 
 
459 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  32.98 
 
 
477 aa  143  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  29.2 
 
 
507 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  31.55 
 
 
504 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  31.2 
 
 
482 aa  140  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  30.9 
 
 
516 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  30.02 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  32.48 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  28.13 
 
 
519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  27.93 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  30 
 
 
370 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  28.82 
 
 
473 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  30.22 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  28.02 
 
 
430 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  29.41 
 
 
446 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  32.05 
 
 
383 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  27.77 
 
 
491 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  27.05 
 
 
422 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  27.48 
 
 
423 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  26.34 
 
 
538 aa  100  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  29.96 
 
 
490 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  27.17 
 
 
447 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  26.5 
 
 
414 aa  97.4  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  27.71 
 
 
451 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  26.92 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  26.92 
 
 
421 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  26.87 
 
 
553 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  24.84 
 
 
450 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  24.84 
 
 
450 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  25.3 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.88 
 
 
553 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.88 
 
 
553 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  26.67 
 
 
553 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  26.88 
 
 
549 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  26.67 
 
 
553 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  26.68 
 
 
553 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  26.99 
 
 
542 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  26.06 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  26.9 
 
 
585 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  26.91 
 
 
559 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  25.73 
 
 
592 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  25.53 
 
 
592 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  26.91 
 
 
559 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  25.73 
 
 
592 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  26.91 
 
 
559 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  26.91 
 
 
559 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  26.91 
 
 
559 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  26.32 
 
 
592 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  24.95 
 
 
590 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  27.25 
 
 
587 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  24.67 
 
 
587 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  25.75 
 
 
569 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  25.25 
 
 
560 aa  77  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  25.59 
 
 
562 aa  75.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  26.94 
 
 
585 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  24.95 
 
 
592 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  24.95 
 
 
592 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  24.95 
 
 
592 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  24.95 
 
 
592 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  25.83 
 
 
558 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  27.91 
 
 
560 aa  68.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  26.67 
 
 
568 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  24.9 
 
 
589 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  25.67 
 
 
315 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1616  SPFH domain-containing protein  25.48 
 
 
477 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  25.27 
 
 
570 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  29.37 
 
 
744 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.61 
 
 
281 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  25.26 
 
 
279 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  21.46 
 
 
691 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.92 
 
 
257 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  24.04 
 
 
679 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>