86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3022 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  100 
 
 
570 aa  1127    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  53.64 
 
 
549 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  53.41 
 
 
553 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  53.64 
 
 
553 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  53.64 
 
 
553 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  53.73 
 
 
553 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.54 
 
 
553 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  53.36 
 
 
542 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  51.24 
 
 
558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.46 
 
 
553 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  53.41 
 
 
559 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  53.41 
 
 
559 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  53.6 
 
 
559 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  53.6 
 
 
559 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  53.41 
 
 
559 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  48.32 
 
 
569 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  46.82 
 
 
592 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  46.82 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  46.82 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  46.82 
 
 
592 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  46.05 
 
 
604 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  48.61 
 
 
592 aa  435  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  48.62 
 
 
592 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  48.62 
 
 
592 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  48.62 
 
 
592 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  46.38 
 
 
587 aa  428  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  46.02 
 
 
585 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  47.46 
 
 
590 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  46.84 
 
 
595 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  45.52 
 
 
589 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  44.33 
 
 
585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  43.06 
 
 
587 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  44.51 
 
 
568 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  43.27 
 
 
562 aa  355  7.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  45.42 
 
 
560 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  43.55 
 
 
560 aa  292  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  48.21 
 
 
964 aa  290  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  32.4 
 
 
542 aa  220  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  32.03 
 
 
744 aa  170  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  31.14 
 
 
693 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  32.25 
 
 
672 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  28.7 
 
 
644 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  29.36 
 
 
688 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  27.39 
 
 
691 aa  146  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  29.43 
 
 
688 aa  146  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  28.77 
 
 
681 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  28.74 
 
 
672 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  27.96 
 
 
667 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  28.53 
 
 
668 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  27.09 
 
 
700 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  27.27 
 
 
712 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  27.57 
 
 
679 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  30.26 
 
 
748 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  24.24 
 
 
601 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  24.24 
 
 
601 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  24.66 
 
 
695 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  24.9 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  26.27 
 
 
507 aa  80.9  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  26.98 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  25.24 
 
 
495 aa  74.3  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  26.99 
 
 
519 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  26.81 
 
 
507 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  25.7 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  25.45 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.45 
 
 
526 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.45 
 
 
526 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  25.45 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  25.45 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  25.45 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.45 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  26.32 
 
 
524 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  26.05 
 
 
524 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  25.79 
 
 
524 aa  64.7  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  22.78 
 
 
467 aa  62  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  23.59 
 
 
509 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  26.14 
 
 
500 aa  58.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  21.9 
 
 
468 aa  57  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  21.49 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  24.86 
 
 
477 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  26.04 
 
 
503 aa  55.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  24.75 
 
 
489 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  25.08 
 
 
492 aa  54.3  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  23.94 
 
 
537 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  25 
 
 
513 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  24.52 
 
 
383 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  25.91 
 
 
447 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.936063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>