60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3820 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  75.37 
 
 		 681 aa  965    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  76.55 
 
 		 688 aa  976    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  63.62 
 
 		 644 aa  783    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  100 
 
 		 691 aa  1362    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  63.68 
 
 		 672 aa  788    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  76.78 
 
 		 688 aa  981    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  52.19 
 
 		 667 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  50.08 
 
 		 700 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  49.93 
 
 		 712 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  49.31 
 
 		 748 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  47.14 
 
 		 679 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  47.5 
 
 		 668 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  34.36 
 
 		 695 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  30.18 
 
 		 585 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  29.65 
 
 		 558 aa  158  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  30.25 
 
 		 587 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  30.29 
 
 		 560 aa  153  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  31.87 
 
 		 568 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  27.03 
 
 		 744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  28.35 
 
 		 553 aa  142  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  28.35 
 
 		 553 aa  142  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.35 
 
 		 553 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  28.35 
 
 		 549 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  28.35 
 
 		 553 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  28.35 
 
 		 553 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.35 
 
 		 553 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  26.77 
 
 		 592 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  26.55 
 
 		 592 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  27.83 
 
 		 604 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  26.55 
 
 		 592 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  27.64 
 
 		 562 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  28.54 
 
 		 542 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  26.76 
 
 		 592 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  26.76 
 
 		 592 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  26.76 
 
 		 592 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  26.76 
 
 		 592 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  26.86 
 
 		 589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  27.34 
 
 		 595 aa  134  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  30.93 
 
 		 559 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  29.64 
 
 		 569 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  25.33 
 
 		 587 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  25.78 
 
 		 592 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  25.71 
 
 		 590 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  26.18 
 
 		 585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  30.67 
 
 		 559 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  30.67 
 
 		 559 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  30.67 
 
 		 559 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  30.67 
 
 		 559 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  27.03 
 
 		 570 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  26.32 
 
 		 560 aa  122  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  28.65 
 
 		 964 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  25.7 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  24.04 
 
 		 672 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  25.71 
 
 		 693 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  24.01 
 
 		 475 aa  55.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  22.11 
 
 		 601 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  22.11 
 
 		 601 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  24.01 
 
 		 507 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  23.88 
 
 		 477 aa  45.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  25.06 
 
 		 507 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>