108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0144 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1048    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  47.79 
 
 		 507 aa  438  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  47.96 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  48.1 
 
 		 473 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  39.96 
 
 		 500 aa  335  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  26.68 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  25.09 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  27.5 
 
 		 507 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  27.99 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  34.12 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  25.93 
 
 		 538 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  26.67 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  25.39 
 
 		 477 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  26.67 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  30.3 
 
 		 446 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  28.54 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  30.67 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  28.57 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  28.57 
 
 		 524 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  28.05 
 
 		 524 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  25.4 
 
 		 430 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.05 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.05 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  28.05 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  28.05 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.05 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  28.05 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  28.05 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  23.71 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  24.48 
 
 		 422 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  26 
 
 		 537 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  27.81 
 
 		 450 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  27.81 
 
 		 450 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  29.9 
 
 		 503 aa  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  26.8 
 
 		 509 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  24.76 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  27.75 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  26.76 
 
 		 451 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06177  flotillin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G08180)  30.48 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.226938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  27.98 
 
 		 472 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  29.04 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  25.86 
 
 		 482 aa  97.1  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  32.6 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  31.32 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  27.87 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  23.09 
 
 		 447 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  25.28 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  27.78 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  28.06 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  26.01 
 
 		 560 aa  75.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  25.52 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  25.7 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  31.95 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  25 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  26.32 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  27 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  28.48 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  25.82 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  26.34 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  23.18 
 
 		 553 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  23.18 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  23.18 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.18 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  23.18 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  23.79 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.95 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  24.64 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  23.41 
 
 		 542 aa  67  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  25.45 
 
 		 693 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  24.56 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  24.01 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  21.78 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  21.78 
 
 		 559 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  21.78 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  21.78 
 
 		 559 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  22.73 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  24.76 
 
 		 604 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  23.74 
 
 		 590 aa  58.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  22.58 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  23.82 
 
 		 592 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  23.82 
 
 		 592 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  23.82 
 
 		 592 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  22.03 
 
 		 559 aa  57  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  25.66 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  23.82 
 
 		 592 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  25.74 
 
 		 592 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  25.74 
 
 		 592 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  25.74 
 
 		 592 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  27.16 
 
 		 964 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  24.65 
 
 		 592 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  23.61 
 
 		 744 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  25.24 
 
 		 589 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  23.9 
 
 		 560 aa  54.3  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  20.96 
 
 		 570 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  25.41 
 
 		 309 aa  50.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  24.07 
 
 		 558 aa  50.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  20.5 
 
 		 601 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  20.5 
 
 		 601 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  23.64 
 
 		 568 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  22.59 
 
 		 311 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>