253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8817 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8817  band 7 protein  100 
 
 
518 aa  1014    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.209913  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0712  band 7 protein  59.44 
 
 
496 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.350479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0367  hypothetical protein  60.48 
 
 
499 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1073  band 7 protein  45.58 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.532983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1761  band 7 protein  48.18 
 
 
480 aa  331  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000813907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8346  band 7 protein  50.51 
 
 
383 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0503  band 7 protein  42.38 
 
 
370 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00953758  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2091  band 7 protein  34.77 
 
 
516 aa  210  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  33.26 
 
 
507 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  32.64 
 
 
537 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  31.64 
 
 
507 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.24 
 
 
524 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.24 
 
 
526 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  35.24 
 
 
524 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  35.24 
 
 
524 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  30.31 
 
 
495 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  35.24 
 
 
524 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.24 
 
 
526 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  35.24 
 
 
526 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  34.76 
 
 
519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  35.71 
 
 
524 aa  183  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  35.48 
 
 
524 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  35.24 
 
 
524 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2104  band 7 protein  37.1 
 
 
513 aa  177  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  30.18 
 
 
475 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  39.07 
 
 
459 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  28.08 
 
 
489 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  31.87 
 
 
482 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0132  band 7 protein  33.54 
 
 
491 aa  153  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  29.44 
 
 
509 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  32.96 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  33.33 
 
 
490 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2499  Band 7 protein  31.27 
 
 
446 aa  133  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0504738  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0945  band 7 protein  30.09 
 
 
451 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  29.37 
 
 
477 aa  123  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  27.39 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0403  band 7 protein  31.86 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  28.65 
 
 
467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  31.25 
 
 
447 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.936063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0402  band 7 protein  29.31 
 
 
473 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05180  hypothetical protein  27.61 
 
 
499 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3176  band 7 protein  30.88 
 
 
450 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.689378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2920  band 7 protein  30.88 
 
 
450 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  30.24 
 
 
460 aa  116  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  31.52 
 
 
472 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2921  band 7 protein  27.19 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3175  band 7 protein  27.19 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0313  band 7 protein  25.67 
 
 
423 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0445  band 7 protein  33.7 
 
 
538 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116716  normal  0.17273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1398  Band 7 protein  25.7 
 
 
422 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267003  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0946  band 7 protein  26.63 
 
 
430 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2498  Band 7 protein  29.86 
 
 
414 aa  97.8  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.115439  hitchhiker  0.00327007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  27.93 
 
 
500 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  24.88 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  28.08 
 
 
519 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  24.75 
 
 
507 aa  84  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  26.46 
 
 
504 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  26.19 
 
 
309 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  26.52 
 
 
307 aa  62.4  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  27.07 
 
 
315 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  25 
 
 
305 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  25.22 
 
 
361 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  25 
 
 
305 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  22.4 
 
 
592 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  22.4 
 
 
592 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  25.5 
 
 
250 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  22.4 
 
 
592 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  22.4 
 
 
592 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  23.27 
 
 
553 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  23.04 
 
 
304 aa  57.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  23.89 
 
 
553 aa  57  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.25 
 
 
553 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.39 
 
 
553 aa  57  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  23.27 
 
 
553 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  24.79 
 
 
258 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  27.43 
 
 
263 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  25.23 
 
 
256 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  23.27 
 
 
553 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  23.27 
 
 
549 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  31.03 
 
 
644 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.26 
 
 
251 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1525  band 7/Mec-2 family protein  23.95 
 
 
304 aa  53.9  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  26.29 
 
 
260 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  24.89 
 
 
256 aa  53.9  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  22.78 
 
 
311 aa  53.5  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  23.31 
 
 
542 aa  53.9  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  27.94 
 
 
336 aa  53.5  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  24.26 
 
 
249 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  22.9 
 
 
559 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  25.88 
 
 
295 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.41 
 
 
310 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.42 
 
 
286 aa  53.5  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  23.43 
 
 
559 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  27.03 
 
 
310 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  22.9 
 
 
559 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  24.88 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  26.76 
 
 
359 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  22.84 
 
 
559 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  26.11 
 
 
257 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  24.19 
 
 
319 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>