90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0682 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0682  band 7 protein  100 
 
 
568 aa  1104    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0118281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3146  band 7 protein  59.01 
 
 
585 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2882  band 7 protein  58.27 
 
 
587 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.107759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3109  band 7 protein  41.77 
 
 
592 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3622  band 7 protein  42.67 
 
 
587 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1267  band 7 protein  41.77 
 
 
592 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3099  band 7 protein  41.77 
 
 
592 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3252  band 7 protein  41.77 
 
 
592 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1084  band 7 protein  41.83 
 
 
604 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0005  band 7 protein  45.65 
 
 
569 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0238234  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1377  hypothetical protein  40.93 
 
 
592 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3514  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.17 
 
 
553 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01973  band 7 protein  41.8 
 
 
589 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0247971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02871  hypothetical protein  43.88 
 
 
549 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1186  band 7 protein  42.31 
 
 
590 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0648  band 7 protein  43.88 
 
 
553 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3022  band 7 protein  45.7 
 
 
570 aa  381  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2816  band 7 protein  41.68 
 
 
592 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2899  band 7 protein  41.68 
 
 
592 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02921  hypothetical protein  43.88 
 
 
553 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2996  band 7 protein  41.36 
 
 
592 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0649  band 7 protein  44.04 
 
 
553 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4360  SPFH/band 7 domain protein  43.48 
 
 
553 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00349028  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3482  SPFH/band 7 domain protein  44.5 
 
 
542 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.632144  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0804  hypothetical protein  44.04 
 
 
585 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3343  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.28 
 
 
553 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.201295  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2218  hypothetical protein  42.8 
 
 
558 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0946  band 7 protein  42.55 
 
 
595 aa  365  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3388  inner membrane protein YqiK  43.18 
 
 
559 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3554  inner membrane protein YqiK  43.87 
 
 
559 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.695435  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3458  inner membrane protein YqiK  43.68 
 
 
559 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3452  hypothetical protein  43.68 
 
 
559 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357651  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3384  inner membrane protein YqiK  43.68 
 
 
559 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2195  band 7 protein  41.83 
 
 
562 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807864  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1794  band 7 protein  43.36 
 
 
560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.511769  normal  0.250281 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4673  band 7 protein  45.13 
 
 
560 aa  279  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.122447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  42.47 
 
 
964 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0348  band 7 protein  33.69 
 
 
542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3820  band 7 protein  31.77 
 
 
691 aa  176  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22984  normal  0.142828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3477  hypothetical protein  31.77 
 
 
644 aa  173  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3315  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1413  band 7 protein  31.05 
 
 
744 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16180  hypothetical protein  31.71 
 
 
688 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1390  hypothetical protein  31.79 
 
 
688 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6805  hypothetical protein  30.83 
 
 
668 aa  157  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3387  hypothetical protein  30.3 
 
 
681 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4040  band 7 protein  28.85 
 
 
693 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.725913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3700  hypothetical protein  34.92 
 
 
667 aa  147  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1586  hypothetical protein  30.53 
 
 
712 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2848  hypothetical protein  29.4 
 
 
672 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734131  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4688  band 7 protein  31.25 
 
 
700 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2833  putative secreted protein  32.53 
 
 
748 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0265  band 7 protein  28.31 
 
 
672 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00194603  normal  0.0128857 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5460  band 7 protein  31.61 
 
 
679 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal  0.831965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2459  band 7 protein  29.78 
 
 
601 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3650  band 7 protein  29.78 
 
 
601 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00649439  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06503  protease  26.54 
 
 
695 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1382  band 7 protein  25.05 
 
 
475 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000233776  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2255  hypothetical protein  26.03 
 
 
507 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576037  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0860  band 7 protein  26.35 
 
 
504 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  28.54 
 
 
507 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0578  band 7 protein  27.76 
 
 
500 aa  77.8  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0697036  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0334  band 7 protein  25.88 
 
 
507 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0488  flotillin domain-containing protein  27 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0686  SPFH domain/band 7 family protein  25.97 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.797712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0468  band 7 protein  25.97 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0593  spfh domain/band 7 family protein  25.97 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0468  band 7 protein  25.97 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3314  band 7 protein  23.99 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0525  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.97 
 
 
526 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0470  band 7 protein  26.24 
 
 
524 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0613  SPFH domain/band 7 family protein  25.97 
 
 
526 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.97 
 
 
526 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0618  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.97 
 
 
524 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4746  SPFH domain/band 7 family protein  25.97 
 
 
524 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1402  flotillin  25.24 
 
 
489 aa  67  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0725365  normal  0.0723742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2033  band 7 protein  21.88 
 
 
537 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215878  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2287  band 7 protein  26.76 
 
 
467 aa  63.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338349  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2366  band 7 protein  26.18 
 
 
509 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000111319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0144  hypothetical protein  24.05 
 
 
519 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1428  band 7 protein  23.14 
 
 
477 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.534415  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  22.46 
 
 
468 aa  57.4  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5091  band 7 protein  28.3 
 
 
459 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000550559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0782  membrane protease family stomatin/prohibitin-like protein  24.62 
 
 
503 aa  53.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.28446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1144  band 7 protein  24.53 
 
 
473 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.401105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1727  band 7 protein  23.91 
 
 
472 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000752152  normal  0.0958573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0314  band 7 protein  28.16 
 
 
460 aa  50.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2346  band 7 protein  25.28 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1912  band 7 protein  24.83 
 
 
492 aa  48.9  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01370  hypothetical protein  21.95 
 
 
490 aa  48.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1397  Band 7 protein  25.08 
 
 
447 aa  43.5  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.936063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>