124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3023 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  85.8 
 
 		 507 aa  911    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  100 
 
 		 507 aa  1056    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  60.28 
 
 		 508 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  62.2 
 
 		 508 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  62.99 
 
 		 508 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  73.18 
 
 		 507 aa  778    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  53.52 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  53.12 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  53.2 
 
 		 511 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  53.4 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  51.39 
 
 		 515 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  48.96 
 
 		 537 aa  501  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  45.49 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  45.49 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  45.29 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  44.27 
 
 		 524 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  43.61 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  42.61 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  43.5 
 
 		 514 aa  435  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  41.51 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  43.76 
 
 		 522 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  42.34 
 
 		 524 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  41.63 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  41.58 
 
 		 518 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  40.22 
 
 		 537 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  40.82 
 
 		 514 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  42.26 
 
 		 527 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  39.34 
 
 		 524 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  38.73 
 
 		 517 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  42.26 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  39.96 
 
 		 532 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  40.08 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  38.49 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  39.16 
 
 		 528 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  39.13 
 
 		 513 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  38.43 
 
 		 543 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  39.13 
 
 		 531 aa  363  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  38.25 
 
 		 520 aa  361  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  37.87 
 
 		 543 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  39.42 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  38.25 
 
 		 543 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  37.69 
 
 		 543 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.6 
 
 		 508 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.79 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  33.33 
 
 		 538 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  33.33 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  33.99 
 
 		 529 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.7 
 
 		 529 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.75 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.54 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  32.18 
 
 		 538 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  34.38 
 
 		 507 aa  256  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  32.95 
 
 		 537 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  34.89 
 
 		 499 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  35.2 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  34.82 
 
 		 499 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  34.7 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.51 
 
 		 497 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.65 
 
 		 507 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  34.78 
 
 		 501 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  35.36 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.97 
 
 		 502 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  31.29 
 
 		 498 aa  243  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  34.74 
 
 		 511 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  33.53 
 
 		 496 aa  243  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  33.78 
 
 		 502 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.23 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  33.4 
 
 		 494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 523 aa  240  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  33.66 
 
 		 503 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  34.06 
 
 		 492 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  35.13 
 
 		 512 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  33.98 
 
 		 498 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  32.89 
 
 		 517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  32.62 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.48 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.41 
 
 		 509 aa  233  8.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  32.57 
 
 		 510 aa  233  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  33.46 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  32.62 
 
 		 740 aa  232  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  31.04 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  32.48 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  31.77 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 497 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  34.25 
 
 		 515 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  32.88 
 
 		 496 aa  229  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  31.95 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  31.65 
 
 		 495 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  32.05 
 
 		 501 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.56 
 
 		 501 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  31.75 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  31.21 
 
 		 500 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  30.25 
 
 		 500 aa  223  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  32.55 
 
 		 497 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.31 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  32.43 
 
 		 510 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>