More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1412 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3155  zinc metallopeptidase  39.22 
 
 		 936 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3083  M16 family peptidase  95.91 
 
 		 929 aa  1858    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1634  peptidase M16 domain-containing protein  74.49 
 
 		 929 aa  1456    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.554729  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3021  peptidase M16 domain-containing protein  74.6 
 
 		 929 aa  1485    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2850  peptidase M16 domain-containing protein  91.71 
 
 		 929 aa  1779    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03118  hypothetical protein  46.58 
 
 		 904 aa  862    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2420  peptidase M16 domain-containing protein  74.43 
 
 		 925 aa  1452    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1533  peptidase M16-like protein  71.72 
 
 		 929 aa  1426    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2592  peptidase M16 domain-containing protein  69.75 
 
 		 929 aa  1395    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2455  peptidase M16 domain-containing protein  91.93 
 
 		 929 aa  1788    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1603  peptidase M16 domain protein  91.82 
 
 		 929 aa  1778    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1412  Insulysin  100 
 
 		 929 aa  1927    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.528026  normal  0.896637 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2773  peptidase M16 domain-containing protein  91.82 
 
 		 929 aa  1782    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.368865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1660  peptidase insulinase family protein  45.62 
 
 		 939 aa  887    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1477  peptidase M16 domain-containing protein  98.92 
 
 		 929 aa  1912    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.602507  normal  0.234952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2671  peptidase M16 domain-containing protein  73.16 
 
 		 929 aa  1451    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2756  peptidase M16 domain-containing protein  91.71 
 
 		 929 aa  1781    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1465  peptidase M16 domain-containing protein  98.17 
 
 		 929 aa  1897    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2163  M16 family peptidase  74.7 
 
 		 929 aa  1453    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.744451  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002859  peptidase insulinase family  46.44 
 
 		 925 aa  886    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  37.5 
 
 		 968 aa  617  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1666  peptidase M16-like  34.25 
 
 		 945 aa  601  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02695  peptidase, M16 family protein  36.17 
 
 		 915 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0492613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2509  peptidase M16 domain-containing protein  32.86 
 
 		 947 aa  525  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3023  peptidase M16-like protein  32.25 
 
 		 941 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00252323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2863  peptidase M16 domain-containing protein  31.31 
 
 		 963 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000086513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08044  a-pheromone processing metallopeptidase Ste23 (AFU_orthologue; AFUA_5G02010)  29.71 
 
 		 1100 aa  421  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.356116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56651  predicted protein  29.73 
 
 		 1074 aa  403  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.798232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3480  peptidase M16 domain-containing protein  29.24 
 
 		 958 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0913  peptidase M16 domain protein  29.39 
 
 		 986 aa  395  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3390  peptidase M16 domain protein  29.53 
 
 		 982 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18335  predicted protein  29.63 
 
 		 995 aa  393  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05710  insulin degrading enzyme, putative  28.52 
 
 		 1162 aa  385  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3815  peptidase M16 domain-containing protein  29.05 
 
 		 962 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0788727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3079  Pitrilysin  29.29 
 
 		 946 aa  379  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1042  peptidase M16 domain-containing protein  29.06 
 
 		 962 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.923143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3232  protease III precursor  28.95 
 
 		 962 aa  373  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.730606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0990  protease III  28.95 
 
 		 962 aa  373  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3190  Pitrilysin  27.77 
 
 		 967 aa  363  9e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.434447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3008  Pitrilysin  27.87 
 
 		 981 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50598  predicted protein  28.27 
 
 		 1008 aa  354  4e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.732398  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3141  protease 3  28.93 
 
 		 962 aa  353  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3207  protease 3  28.93 
 
 		 962 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3321  protease 3  28.93 
 
 		 962 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3158  protease 3  28.93 
 
 		 962 aa  351  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.782979  normal  0.694921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2968  protease III  28.39 
 
 		 962 aa  345  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.436713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02669  protease III  28.59 
 
 		 962 aa  345  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3141  protease III  28.39 
 
 		 962 aa  345  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3221  protease 3  28.81 
 
 		 962 aa  345  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.405779 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02630  hypothetical protein  28.59 
 
 		 962 aa  345  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45399  predicted protein  26.91 
 
 		 916 aa  344  5e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0870  peptidase M16 domain protein  28.28 
 
 		 962 aa  343  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3041  protease III  28.51 
 
 		 962 aa  343  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2967  protease III  28.28 
 
 		 962 aa  343  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0894  peptidase M16 domain-containing protein  28.28 
 
 		 962 aa  343  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4086  protease III  28.28 
 
 		 962 aa  342  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.851704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3264  peptidase M16 domain-containing protein  28.39 
 
 		 960 aa  338  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_267  predicted protein  27.5 
 
 		 952 aa  324  5e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0986316  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47929  predicted protein  33.49 
 
 		 1272 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0190  insulinase family metalloprotease  23.91 
 
 		 939 aa  206  2e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.645084  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28795  predicted protein  22.73 
 
 		 1246 aa  160  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.923761  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0514  coenzyme PQQ synthesis protein F  29.31 
 
 		 779 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5156  pqqF protein. metallo peptidase. MEROPS family M16A  31.58 
 
 		 808 aa  155  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4669  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.45 
 
 		 762 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39010  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  30.87 
 
 		 775 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0381  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  29.97 
 
 		 766 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3322  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein F  30.93 
 
 		 763 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149192  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0405  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.98 
 
 		 809 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0409  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  33.5 
 
 		 766 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4822  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  32.47 
 
 		 760 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47985  predicted protein  27.69 
 
 		 932 aa  112  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1937  coenzyme PQQ biosynthesis protein PqqF  30.46 
 
 		 794 aa  103  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.979365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41610  coenzyme PQQ biosynthesis protein F  29.56 
 
 		 843 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  25.93 
 
 		 419 aa  100  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  26.05 
 
 		 431 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  23.57 
 
 		 419 aa  99  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  27.12 
 
 		 453 aa  96.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  24.58 
 
 		 419 aa  96.3  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  22.67 
 
 		 984 aa  92.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  25.76 
 
 		 440 aa  92.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  25.21 
 
 		 431 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  25.42 
 
 		 413 aa  92.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3614  peptidase M16 domain protein  24.68 
 
 		 424 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  26.97 
 
 		 424 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  26.97 
 
 		 424 aa  91.3  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4309  peptidase M16-like  26.01 
 
 		 413 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  22.25 
 
 		 979 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0028  peptidase M16 domain protein  25.26 
 
 		 423 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 		 476 aa  87  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  23.57 
 
 		 415 aa  87  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  26.06 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  26.06 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  26.91 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  26.91 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  21.44 
 
 		 976 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  28.82 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0364  processing peptidase  25.34 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  25.6 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  26.51 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1315  peptidase M16 domain protein  25.17 
 
 		 418 aa  84  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>