192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0095 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  98.74 
 
 
635 aa  1292    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  99.06 
 
 
635 aa  1294    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  74.16 
 
 
621 aa  966    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  100 
 
 
635 aa  1303    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  37.96 
 
 
633 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  37.33 
 
 
630 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  39.45 
 
 
628 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  37.26 
 
 
636 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  38.37 
 
 
639 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  36.94 
 
 
609 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  36.99 
 
 
608 aa  353  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  36.64 
 
 
610 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  36.09 
 
 
607 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  36.09 
 
 
607 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  36.09 
 
 
607 aa  347  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  34.09 
 
 
615 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  38.2 
 
 
611 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  33.76 
 
 
615 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  33.44 
 
 
615 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  32.54 
 
 
602 aa  338  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  35.43 
 
 
605 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  35.24 
 
 
616 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  33.28 
 
 
628 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  34.65 
 
 
616 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  35.25 
 
 
615 aa  337  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  35.24 
 
 
616 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  33.18 
 
 
614 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  34.16 
 
 
616 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  38.38 
 
 
614 aa  336  9e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  38.17 
 
 
614 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  37.89 
 
 
614 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  37.79 
 
 
614 aa  334  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  35.4 
 
 
622 aa  333  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  32.52 
 
 
617 aa  332  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  37.94 
 
 
617 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  34.89 
 
 
614 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  32.55 
 
 
618 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  31.66 
 
 
613 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  34.73 
 
 
611 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  32.05 
 
 
617 aa  313  5.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  35.89 
 
 
627 aa  313  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  35.79 
 
 
604 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  30.82 
 
 
613 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  33.66 
 
 
625 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  32.33 
 
 
603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  32.01 
 
 
603 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  32.29 
 
 
601 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  32.4 
 
 
601 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  34.28 
 
 
609 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  32.24 
 
 
601 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  32.17 
 
 
603 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  33.44 
 
 
609 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  35.4 
 
 
629 aa  303  9e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  31.49 
 
 
625 aa  303  9e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  33.59 
 
 
616 aa  302  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  32.25 
 
 
601 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  33.65 
 
 
611 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  33.81 
 
 
609 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  36.66 
 
 
586 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  32.54 
 
 
591 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  33.81 
 
 
609 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  33.81 
 
 
609 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  31.96 
 
 
603 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  33.28 
 
 
609 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  36.32 
 
 
628 aa  299  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  36.26 
 
 
1283 aa  299  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  33.12 
 
 
619 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  33.55 
 
 
609 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  33.07 
 
 
609 aa  296  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  32.62 
 
 
599 aa  296  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  32.72 
 
 
607 aa  295  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  31.59 
 
 
603 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  31.85 
 
 
605 aa  294  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  36.45 
 
 
611 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  31.63 
 
 
624 aa  292  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.1 
 
 
588 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  33.46 
 
 
618 aa  291  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  31.93 
 
 
610 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  32.09 
 
 
585 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  32.96 
 
 
609 aa  287  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  33.67 
 
 
594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  32.1 
 
 
616 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.49 
 
 
602 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  31.69 
 
 
599 aa  281  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  32.41 
 
 
619 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  33.21 
 
 
590 aa  277  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  31.53 
 
 
587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  32.03 
 
 
609 aa  273  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  30.77 
 
 
610 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  33.39 
 
 
592 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  32.16 
 
 
599 aa  269  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  35.5 
 
 
621 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.82 
 
 
583 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  32.08 
 
 
605 aa  258  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  30.34 
 
 
589 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  33.48 
 
 
595 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  31.26 
 
 
598 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  32.9 
 
 
551 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  31.54 
 
 
608 aa  250  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  31.15 
 
 
621 aa  250  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>