239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28080 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28080  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  56.1 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  52.1 
 
 		 186 aa  165  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  34.97 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  35.96 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  34.83 
 
 		 183 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  34.43 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  40.24 
 
 		 183 aa  110  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  39.16 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  33.52 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  34.24 
 
 		 184 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  39.16 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  40.54 
 
 		 188 aa  106  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  35.88 
 
 		 192 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  32.97 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  34.24 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  34.07 
 
 		 201 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  38 
 
 		 186 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  34.55 
 
 		 182 aa  103  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  35.09 
 
 		 185 aa  103  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  35.33 
 
 		 249 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  36.59 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  33.87 
 
 		 186 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  34.25 
 
 		 185 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  33.15 
 
 		 183 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  32.6 
 
 		 183 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  32.1 
 
 		 187 aa  95.5  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  31.95 
 
 		 185 aa  95.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  55.56 
 
 		 199 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  32.97 
 
 		 184 aa  95.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  34.15 
 
 		 186 aa  95.1  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  31.71 
 
 		 189 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  32.1 
 
 		 208 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  35 
 
 		 433 aa  94  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  34.73 
 
 		 189 aa  93.6  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  33.87 
 
 		 183 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  33.51 
 
 		 185 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  35.5 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  32.93 
 
 		 183 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  32.1 
 
 		 180 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  33.33 
 
 		 189 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  31.33 
 
 		 189 aa  90.5  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  31.18 
 
 		 185 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  32.04 
 
 		 184 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  52.5 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  36.88 
 
 		 434 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  33.53 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  31.21 
 
 		 188 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  31.06 
 
 		 180 aa  87.8  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  31.06 
 
 		 180 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  31.06 
 
 		 180 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  36 
 
 		 434 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  53.09 
 
 		 193 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  32.6 
 
 		 187 aa  87  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  51.85 
 
 		 193 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  27.72 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  49.38 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  30.22 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  42.86 
 
 		 194 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  31.21 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  51.85 
 
 		 193 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  30.49 
 
 		 195 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  32.32 
 
 		 187 aa  84.3  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  30.77 
 
 		 195 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  42 
 
 		 212 aa  84.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  45.05 
 
 		 196 aa  83.6  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  30.72 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  43.96 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  38.18 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  47.44 
 
 		 193 aa  80.5  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  39.8 
 
 		 202 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  48.15 
 
 		 194 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  40.21 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  29.63 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  41.82 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  46.91 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  40 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  40.21 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  41.25 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  30.86 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  31.9 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  40 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  41.76 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  41.25 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  30.3 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  43.01 
 
 		 201 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  48.19 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  44.87 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  41.67 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  34.51 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  40.4 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  42.86 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  44.44 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  45.12 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  38.95 
 
 		 215 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  30 
 
 		 185 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  44.44 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  38 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  42.68 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>