149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19210  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0436232 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0028  hypothetical protein  37.28 
 
 
279 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3344  DegV family protein  29.86 
 
 
277 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000036416  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  28.78 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11340  DegV family protein  27.24 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  28.64 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  28.64 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  25.12 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  26.36 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  25.8 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  25.68 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  27.08 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1698  degV family protein  30.14 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  27.23 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  26.91 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  24.62 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  27.31 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  26.48 
 
 
280 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  23.66 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  22.83 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  22.83 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  26.39 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  26.39 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  26.48 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  26.09 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  26.48 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  26.48 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  26.55 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  28.57 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  26.55 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  25.62 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  24.63 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  28.44 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1267  degV family protein  23.51 
 
 
311 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  27.31 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0521  hypothetical protein  26.07 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  24.81 
 
 
287 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  23.64 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  23.05 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  25.22 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  25.11 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2246  degV family protein  27.39 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  23.88 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  22.7 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  27.84 
 
 
281 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  26.13 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  25.1 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1050  DegV  23.62 
 
 
311 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  23.4 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  23.31 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  24.19 
 
 
282 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0028  degV family protein  30.43 
 
 
280 aa  59.3  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1226  degV family protein  23.57 
 
 
637 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185593  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  22.13 
 
 
285 aa  58.9  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1102  degV family protein  29.17 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0785  degV family protein  20.93 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  23.19 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  23.02 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  25.65 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  24.22 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  24.91 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  22.64 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  23.02 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  22.64 
 
 
286 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0421  degV family protein  25.78 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  22.64 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  22.64 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  22.64 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  27.27 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  26.37 
 
 
294 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  23.02 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  25.38 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  22.35 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  23.46 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  24.54 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  22.26 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1346  degV family protein  24.09 
 
 
285 aa  56.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000423289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  21.26 
 
 
282 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2832  degV family protein  25.78 
 
 
281 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  24.51 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  23.13 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  26.13 
 
 
282 aa  55.5  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  27.35 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0910  hypothetical protein  26.87 
 
 
285 aa  55.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  27.83 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2518  degV family protein  25.78 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1078  degV family protein  23.11 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  24.74 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1292  degV family protein  25.56 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.108694  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1563  degV family protein  28.19 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  23.83 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  19.01 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  26.41 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0288  DegV family protein  24.59 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  25.11 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  26.72 
 
 
279 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  22.96 
 
 
293 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  22.66 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1009  hypothetical protein  23.74 
 
 
295 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000831785  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0322  DegV family protein  25 
 
 
277 aa  52.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>