More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18450 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_18450  short chain dehydrogenase  100 
 
 
279 aa  568  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0882393  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1001  short chain dehydrogenase  74.91 
 
 
301 aa  422  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.12 
 
 
277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0215  short chain dehydrogenase  58.67 
 
 
275 aa  324  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4340  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 
280 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0293254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3000  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 
272 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0641388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
285 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.47 
 
 
306 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.84 
 
 
280 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439013  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.21 
 
 
279 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.288274  normal  0.29741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.64 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.64422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.37 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.63 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.56 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.27 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5231  short chain dehydrogenase  26.5 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0476444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.26 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  26.32 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.62 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5098  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.64 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2450  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  26.27 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0588797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  27.02 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.63 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.29 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  27.37 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2949  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  25.71 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  26.48 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  26.48 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  26.48 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  27.37 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  27.37 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.64 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.72 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.21 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  27.01 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3604  putative dehydrogenase  24.35 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055827  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.95 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  24.73 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.57 
 
 
258 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.67 
 
 
261 aa  63.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2114  3 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase/carbonyl reductase  26.77 
 
 
259 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 
242 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3786  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  25.84 
 
 
274 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71727  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3782  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  25.84 
 
 
274 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3855  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  25.84 
 
 
274 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  24.44 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
273 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1390  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  28.25 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  25.36 
 
 
261 aa  62.4  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2733  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  26.67 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.93 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.05 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  25.09 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.34 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.264483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.48 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195862  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.34 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  24.07 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.73 
 
 
251 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  23.48 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  24.35 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.51 
 
 
278 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.09 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  27.02 
 
 
272 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  25.33 
 
 
254 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.28 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.53 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  27.86 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.21 
 
 
255 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.31 
 
 
242 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.74 
 
 
259 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.09 
 
 
265 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.27 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  23.13 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.43 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5663  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  25.4 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363313  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6604  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  25.4 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  23.99 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  24.54 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.85 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1394  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  27.24 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.44 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.89 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.66 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.38 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  21.91 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0895  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  27.78 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.013191  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>