180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15320  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  100 
 
 		 341 aa  652    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal  0.0227191 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1212  extracellular solute-binding protein family 3  40.25 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000663729  normal  0.0536092 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12400  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  41.85 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0984  extracellular solute-binding protein family 3  35.19 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2443  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2403  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2449  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  26.36 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  26.99 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.6 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.6 
 
 		 485 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  25.86 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  27.66 
 
 		 247 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 276 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  24.07 
 
 		 281 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 264 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 262 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 276 aa  52.8  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  26.34 
 
 		 598 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.09 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  26.11 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 604 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  25.34 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  25.89 
 
 		 596 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  25.21 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  20.92 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.85 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.01 
 
 		 264 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 246 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1664  extracellular solute-binding protein family 3  42.86 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 272 aa  50.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  24.28 
 
 		 271 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  23.83 
 
 		 286 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  26.78 
 
 		 257 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.69 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  24.47 
 
 		 264 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  27.66 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.43 
 
 		 266 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  27.02 
 
 		 278 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.43 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2113  extracellular solute-binding protein family 3  38.74 
 
 		 764 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  24.48 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 309 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0207  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.33 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.670956  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.02 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.4 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.14 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.4 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  28.57 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 249 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.49 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5110  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  hitchhiker  0.00536253 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2763  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3279  extracellular solute-binding protein family 3  25.79 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  22.68 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  40.58 
 
 		 264 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  40.58 
 
 		 264 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  25.21 
 
 		 268 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  24.14 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  37.68 
 
 		 288 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  24.14 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  40.58 
 
 		 264 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  24.68 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  24.14 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  24.68 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  28.02 
 
 		 250 aa  47  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  23.46 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 620 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  41.67 
 
 		 489 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 		 489 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2257  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 266 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 		 489 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  20.39 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  20.39 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  20.39 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  40.58 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>