More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_12820  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  100 
 
 
279 aa  565  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  47.69 
 
 
641 aa  252  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
627 aa  244  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  44.19 
 
 
510 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 
630 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  41.3 
 
 
531 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  40.72 
 
 
553 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  41.7 
 
 
557 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  43.78 
 
 
574 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  36.58 
 
 
585 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2291  ABC transporter related  41.63 
 
 
535 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4400  ABC transporter related  41.39 
 
 
543 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
568 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2385  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 
566 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  36.69 
 
 
541 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2424  cobalt ABC transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 
566 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000216919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2641  ABC transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 
566 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  36.11 
 
 
512 aa  178  8e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1500  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.78 
 
 
573 aa  178  9e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0943  ABC transporter related  40.69 
 
 
547 aa  178  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.742397  normal  0.41118 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  36.43 
 
 
530 aa  177  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3111  ABC transporter related protein  40.6 
 
 
540 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0317761  normal  0.310337 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  39.44 
 
 
284 aa  178  1e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2653  ABC transporter related  38.21 
 
 
490 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2709  ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
566 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2658  ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
566 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  38.31 
 
 
582 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2461  ABC transporter ATP-binding protein  37.01 
 
 
566 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000483746  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  36.05 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.46 
 
 
641 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  36.14 
 
 
518 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 
277 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  35.94 
 
 
568 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  36.33 
 
 
576 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2668  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 
566 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0711129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  40.52 
 
 
571 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1759  ABC transporter related  36.4 
 
 
569 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1787  ABC transporter related  36.4 
 
 
569 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40 
 
 
590 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23160  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.36 
 
 
473 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.452104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  33.33 
 
 
593 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  36.13 
 
 
574 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  38.28 
 
 
497 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  41.36 
 
 
534 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 
489 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  35.04 
 
 
605 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  38.38 
 
 
571 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  36.69 
 
 
280 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  38.41 
 
 
278 aa  165  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17470  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.37 
 
 
580 aa  165  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00927794  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  37.2 
 
 
568 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  37.37 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  42.22 
 
 
509 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  33.83 
 
 
290 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  36.57 
 
 
530 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  35.51 
 
 
566 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  39.83 
 
 
581 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.91 
 
 
280 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.1 
 
 
1091 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  32.09 
 
 
275 aa  160  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.27 
 
 
285 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  33.45 
 
 
283 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  40.51 
 
 
548 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  33.45 
 
 
283 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  36.02 
 
 
272 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  35.87 
 
 
281 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  36.64 
 
 
286 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.97 
 
 
286 aa  158  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2666  ABC transporter, ATP-binding protein  33.46 
 
 
566 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  42.58 
 
 
516 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 
284 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0335  ABC transporter related  37.44 
 
 
228 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0378349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2676  ABC transporter related  36 
 
 
587 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0827069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  36.4 
 
 
277 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0900  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
474 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.318753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  35.22 
 
 
303 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2158  ABC transporter, ATP-binding protein  36.94 
 
 
502 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0430843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  35.29 
 
 
581 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1633  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
558 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.104044  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0419  ABC transporter ATPase  37.85 
 
 
537 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0259  hypothetical protein  39.13 
 
 
469 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.85 
 
 
281 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2658  ABC transporter, ATP-binding protein  33.46 
 
 
566 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.558604  hitchhiker  0.000000784356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  37.4 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.38 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  38.16 
 
 
501 aa  152  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  37.36 
 
 
273 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1767  ABC transporter related  35.81 
 
 
493 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0255  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 
474 aa  152  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
491 aa  152  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0243  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
491 aa  151  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25730  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.04 
 
 
479 aa  151  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 
269 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2290  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.2 
 
 
269 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.61 
 
 
280 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.02 
 
 
562 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.66 
 
 
280 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.25 
 
 
300 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.25 
 
 
300 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.25 
 
 
280 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>