More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09940  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 392 aa  800    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.128931  hitchhiker  0.00000254642 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06940  cysteine desulfurase family protein  51.14 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.417246  normal  0.55711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1347  aminotransferase class V  52.86 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145912  normal  0.878821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  45.29 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  45.04 
 
 		 384 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.89 
 
 		 392 aa  315  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  42.86 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  42.46 
 
 		 394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.16 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.13 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  44.5 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  43.51 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  42.17 
 
 		 392 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.87 
 
 		 393 aa  296  4e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  43.25 
 
 		 409 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  42.68 
 
 		 400 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  42.09 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  46.05 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  43.62 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  41.03 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  43.59 
 
 		 398 aa  289  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.24 
 
 		 382 aa  288  8e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.13 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.18 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  41.78 
 
 		 381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.39 
 
 		 396 aa  285  8e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.31 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  40.71 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  40.71 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.82 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  42.75 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  40.46 
 
 		 381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.36 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  40.46 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  40.2 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  40.46 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  40.2 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  40.2 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  40.2 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.16 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.46 
 
 		 381 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.46 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  40.71 
 
 		 381 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  43.08 
 
 		 383 aa  278  9e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.69 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  38.56 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  38.56 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  40.97 
 
 		 396 aa  275  7e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  40.15 
 
 		 384 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40.76 
 
 		 402 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  41.33 
 
 		 404 aa  272  9e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  41.18 
 
 		 401 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  41.54 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.36 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  43.32 
 
 		 422 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.23 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  40.41 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  42.96 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  40.86 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  41.07 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  42.46 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  39.69 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  41.48 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  39.64 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  39.75 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  39.64 
 
 		 401 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  41.07 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.4 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  38.76 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  42.13 
 
 		 412 aa  260  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  40.56 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1163  NifS family cysteine desulfurase  38.56 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.42 
 
 		 400 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.85 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  39.64 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.34 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.03 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  43.72 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  40.97 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  37.6 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  41.44 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  42.57 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  42.32 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  39.55 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  38.87 
 
 		 397 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  37.69 
 
 		 402 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  42.32 
 
 		 388 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  42.15 
 
 		 1143 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  38.96 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0732  aminotransferase class V  39.69 
 
 		 382 aa  252  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0224667  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  39.18 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  39.29 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  42.57 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  38.07 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1770  NifS family cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.406981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2029  Cysteine desulfurase  41.9 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.243371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.39 
 
 		 398 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  37.24 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>