More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3744 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  56.81 
 
 		 275 aa  251  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  55.98 
 
 		 224 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  55.25 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  56.74 
 
 		 225 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  55.5 
 
 		 224 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  54.25 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  57.14 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  55.71 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  54.55 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  51.12 
 
 		 227 aa  229  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3382  ABC transporter related  52.43 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.75 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  54.19 
 
 		 220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1367  ATPase  50.47 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.137437  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.51 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  52.74 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  48.88 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  48.36 
 
 		 228 aa  218  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  48.92 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.54 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.36 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.49 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  50.93 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.96 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  50.93 
 
 		 231 aa  215  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  48.89 
 
 		 232 aa  215  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  50.72 
 
 		 226 aa  214  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2995  ABC transporter related  51.61 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1139  ABC transporter-related protein  53.18 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1208  ABC transporter related  53.18 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  51.2 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.66 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1119  ABC transporter related  53.23 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  0.0229909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2232  ABC transporter related  49.29 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  49.75 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0890  ABC transporter related  50.72 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.999916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.98 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.98 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.98 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.98 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0860  ABC transporter-related protein  51.69 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0674344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.58 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.25 
 
 		 229 aa  208  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  47.85 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  47.37 
 
 		 227 aa  208  7e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  52.51 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  50 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  48.6 
 
 		 217 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  49.76 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  46.08 
 
 		 238 aa  204  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.5 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  48.76 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1480  ATPase  50 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.34 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.51 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  45.78 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  54.15 
 
 		 229 aa  203  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.26 
 
 		 235 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2040  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.52 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  44.05 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  46.58 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  48.28 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  43.18 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.34 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1987  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43138  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 242 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  47.81 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.03 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.53 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.58 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.26 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>