More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1819 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  48.89 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  47.75 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  44.25 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  43.36 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  42.61 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  42.17 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  39.68 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  40.43 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  33.05 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  43.92 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  37.29 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  37.19 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  40.69 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  36.47 
 
 		 251 aa  121  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  38.07 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  41.38 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  38.07 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  38.22 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.7 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  36.07 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  36.07 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.7 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  36.56 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  39.86 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  43.75 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  36.32 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  40.52 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  45.39 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  32.45 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  34.73 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  37.58 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  32.76 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  38.83 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  35.71 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  38.78 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  38.26 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  39.24 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  34.97 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  42.28 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  39.86 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  36.41 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  43.42 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.9 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  39.02 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  33.97 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  36.07 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  31.29 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  39.13 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  34.54 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  41.3 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  46.34 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  34.87 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.16 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  32.88 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  32.14 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  40 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.82 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  40.67 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  40.24 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  29.44 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  39.29 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  40.77 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  30.26 
 
 		 249 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  40.88 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  39.01 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  36.22 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  41.06 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  41.96 
 
 		 259 aa  95.1  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  40.56 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  31.75 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  40 
 
 		 235 aa  95.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  32.62 
 
 		 236 aa  94  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  41.84 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  34.36 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.57 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  43.14 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  29.87 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  31.39 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>