More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0314 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 289 aa  578  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  77.16 
 
 		 293 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  75.43 
 
 		 290 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  74.39 
 
 		 296 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  74.74 
 
 		 296 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  74.74 
 
 		 296 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  75.43 
 
 		 289 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  76.47 
 
 		 297 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  76.12 
 
 		 296 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  75.78 
 
 		 297 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  75.43 
 
 		 299 aa  441  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0283  cation diffusion facilitator family transporter  76.12 
 
 		 289 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000135254  hitchhiker  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3459  cation diffusion facilitator family transporter  73.26 
 
 		 295 aa  430  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000668227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0281  cation diffusion facilitator family transporter  74.39 
 
 		 289 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000230949  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3568  cation diffusion facilitator family transporter  72.66 
 
 		 289 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000153022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  70.93 
 
 		 289 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4385  cation efflux family protein  47.04 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.592721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  47.74 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  47.69 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  47.9 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  46.24 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  47.92 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  47.92 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  47.92 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  47.92 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  47.92 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  47.92 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  47.92 
 
 		 300 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 		 300 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  46.88 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  47.92 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 		 300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 		 300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  47.55 
 
 		 300 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  47.22 
 
 		 297 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  47.17 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  47.35 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  45.26 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  46.88 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  47.74 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  47.92 
 
 		 298 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  45.26 
 
 		 302 aa  246  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  44.91 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  44.91 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  44.91 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  47.33 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  46.18 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  47.4 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  45.88 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0139  ferrous iron efflux protein F  45.45 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.205512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  45.33 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  45.33 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  46.93 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  44.76 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  45.32 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0241  cation diffusion facilitator family transporter  46.76 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000961232  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  41.13 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09970  Cation efflux protein  44.1 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  43.01 
 
 		 308 aa  211  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4828  cation diffusion facilitator family transporter  45.33 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4753  cation diffusion facilitator family transporter  40.94 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36054  decreased coverage  0.00983844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4947  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  0.395043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0116  cation diffusion facilitator family transporter  38.14 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.358203  normal  0.378394 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  31.56 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  31.56 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  31.56 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  34.17 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  32.62 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  32.14 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  31.18 
 
 		 460 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.22 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  30.22 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0896  cation efflux family protein  30.28 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0221423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  29.56 
 
 		 315 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  28.68 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  28.83 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  32.36 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  32.01 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  31.72 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.6 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  27.66 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  28.36 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  29.51 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  28.36 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  29.03 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  32.06 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  28.67 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  29.79 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  29.51 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  30.32 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  27.01 
 
 		 460 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  28.62 
 
 		 481 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>