More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2057 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  100 
 
 		 315 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  88.89 
 
 		 315 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  88.89 
 
 		 315 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  88.89 
 
 		 315 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  88.57 
 
 		 315 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  88.57 
 
 		 315 aa  567  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  88.57 
 
 		 315 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  88.89 
 
 		 315 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  86.98 
 
 		 310 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  66.99 
 
 		 312 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  32.63 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.58 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.58 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  30 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  31.11 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  28.75 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  27.56 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.93 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  28.9 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  29.89 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  31.36 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  28.77 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  30.9 
 
 		 330 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.54 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  29.54 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.54 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  29.37 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 328 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  28.72 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.91 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.62 
 
 		 329 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  30.89 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  30.48 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  30.14 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.74 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  28.32 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  27.36 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  30.98 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.99 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  26.42 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  27.61 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.94 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  27.41 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.64 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  29.01 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  29.12 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  27.6 
 
 		 329 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  28.03 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  28.26 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  30.45 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.36 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.01 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  28.47 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.97 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  29.6 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.74 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  29.15 
 
 		 363 aa  95.9  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  32.16 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  27.34 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  28.93 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.33 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  25.91 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.25 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  25.34 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  29.18 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  27.02 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  29.29 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.02 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  28.4 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  28.4 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  27.76 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  26.6 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  29.6 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  27.68 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.95 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  30.45 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  26.57 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  24.76 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  26.59 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  28.71 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>