60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4131 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
105 aa  220  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  99.05 
 
 
120 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  99.05 
 
 
105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  97.14 
 
 
120 aa  213  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  63.11 
 
 
112 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  57.69 
 
 
114 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  59 
 
 
116 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  55 
 
 
112 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  57.73 
 
 
115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  52.53 
 
 
112 aa  122  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  53.47 
 
 
118 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  54.84 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  52.53 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  52.53 
 
 
113 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  49.49 
 
 
114 aa  116  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  48 
 
 
117 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  48 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  48 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  45.1 
 
 
109 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  44.12 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  56.25 
 
 
107 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  48.48 
 
 
108 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  53.66 
 
 
103 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  42.86 
 
 
91 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  48.94 
 
 
102 aa  92  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  41.9 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  54.41 
 
 
69 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  62.07 
 
 
73 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  44.33 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  44.44 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  41.84 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  37.62 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  37.37 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  38.27 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  32.99 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  37.11 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  37.04 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  40.96 
 
 
113 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  36.73 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  28 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  35.48 
 
 
190 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  32.69 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  31.07 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0118  putative bacteriophage protein  36.51 
 
 
106 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1352  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  34.72 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  33.33 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  37.1 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  33.33 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  37.1 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0835  phage-like  30.93 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  31.43 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1828  protein of unknown function DUF891  29.03 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0869  protein of unknown function DUF891  35.09 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0724  protein of unknown function DUF891  29.85 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000648647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  31.75 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2420  protein of unknown function DUF891  28.42 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>