More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3182 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  781    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  36.49 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  35.99 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  35.69 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  32.67 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  31.07 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  32.68 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  29.54 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  29.54 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  29.2 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  29.54 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  29.54 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  29.48 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  31.56 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  31.96 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  31.52 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.39 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  30.17 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 412 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  31.2 
 
 		 389 aa  162  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  35.16 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  29.28 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  30.97 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  28.57 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  30.95 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  29.25 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  28.95 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  30.84 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  29.91 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  28.53 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  32.51 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 395 aa  154  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  29.13 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  28.8 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  28.8 
 
 		 451 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 391 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  27.06 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  32.51 
 
 		 391 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  29.18 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 404 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  30.93 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  28.46 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  28.12 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  28.41 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.97 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.97 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  31.37 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 390 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 413 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  31.37 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.65 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.97 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  30.47 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  28.27 
 
 		 407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  31 
 
 		 405 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  31.01 
 
 		 390 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>