85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0870 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1071    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  44.74 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  37.34 
 
 		 530 aa  317  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  38.42 
 
 		 341 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  37.22 
 
 		 345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  36.93 
 
 		 345 aa  213  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  37.22 
 
 		 345 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  35.97 
 
 		 345 aa  211  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  36.89 
 
 		 396 aa  210  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  36.75 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  38.04 
 
 		 349 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  36.96 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  36.96 
 
 		 344 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  36.68 
 
 		 344 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  36.68 
 
 		 344 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  37.69 
 
 		 345 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  35.91 
 
 		 347 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  37.31 
 
 		 349 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  34.6 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  35.24 
 
 		 371 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  35.9 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  35.9 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  26.43 
 
 		 721 aa  150  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  30.37 
 
 		 416 aa  141  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  29.34 
 
 		 420 aa  135  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  28.98 
 
 		 427 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  35.03 
 
 		 595 aa  133  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  38.79 
 
 		 364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  27.65 
 
 		 424 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  27.85 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  31.23 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  38.35 
 
 		 383 aa  125  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  32.18 
 
 		 407 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  31.86 
 
 		 407 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  29.53 
 
 		 777 aa  113  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  25.89 
 
 		 831 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  29.64 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  31.9 
 
 		 357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  31.54 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  31.08 
 
 		 393 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  28.66 
 
 		 456 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  31.54 
 
 		 367 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  26.7 
 
 		 428 aa  92.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  28.53 
 
 		 746 aa  88.6  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  28.32 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  28.12 
 
 		 686 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  27.86 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  32.62 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  32.1 
 
 		 474 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  29.41 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 		 632 aa  67  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  33.06 
 
 		 520 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  30.92 
 
 		 963 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  38.18 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  26.89 
 
 		 675 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  28.98 
 
 		 960 aa  58.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  25.89 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  30.67 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  28.57 
 
 		 720 aa  57.4  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  28.2 
 
 		 494 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  29.63 
 
 		 539 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  25.34 
 
 		 503 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  26.22 
 
 		 577 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  26.22 
 
 		 577 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  26.22 
 
 		 577 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  28.86 
 
 		 969 aa  54.7  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  27.08 
 
 		 768 aa  54.3  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  29.17 
 
 		 791 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  26.25 
 
 		 436 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  28.82 
 
 		 436 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  28.05 
 
 		 733 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  30.43 
 
 		 802 aa  50.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  28.03 
 
 		 435 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.53 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  28 
 
 		 342 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  26.58 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  30.72 
 
 		 800 aa  47.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  26.38 
 
 		 815 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  28.05 
 
 		 522 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  25.76 
 
 		 308 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  27.07 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  23.98 
 
 		 1892 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  27.39 
 
 		 615 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  26.6 
 
 		 698 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>