115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2099 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
287 aa  598  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.1 
 
 
288 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  27.47 
 
 
298 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.69 
 
 
343 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.64 
 
 
552 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
567 aa  97.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
585 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
567 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.1 
 
 
594 aa  95.9  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
572 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.21 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
629 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  23.78 
 
 
623 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 
619 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 
606 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 
610 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 
610 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 
619 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.19 
 
 
299 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
606 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  22.11 
 
 
572 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  26.09 
 
 
324 aa  89  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
619 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  26.71 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
563 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  24.09 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.56 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  23.26 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  23.92 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.87 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  24.5 
 
 
563 aa  79.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  22.82 
 
 
571 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  21.97 
 
 
567 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.77 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  26.34 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  23.51 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  22.79 
 
 
558 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  24.75 
 
 
568 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  23.76 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.45 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.7 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.54 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  22.88 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  21.72 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  21.75 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  22.64 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  22.55 
 
 
575 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.21 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  22.77 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  21.68 
 
 
593 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  24.25 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  22.71 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  22.15 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  24.92 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.31 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  24.27 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.39 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  21.38 
 
 
573 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  21.38 
 
 
573 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  24.74 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  20.96 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  21.79 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.34 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.1 
 
 
536 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.05 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.64 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  20.36 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  20.38 
 
 
568 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  20.38 
 
 
568 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.12 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.16 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.65 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  21.45 
 
 
324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  21.45 
 
 
324 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.94 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.16 
 
 
304 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  23.24 
 
 
306 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.4 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  21.15 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.27 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  21.09 
 
 
327 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  21.09 
 
 
327 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  22.99 
 
 
304 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.7 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.86 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.17 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  24.88 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.47 
 
 
404 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.6 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.48 
 
 
308 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.97 
 
 
309 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.34 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  23.21 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  19.58 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.11 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.41 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.49 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.2 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.4 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>