More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3952 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3952  DrgA protein  100 
 
 		 201 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.335836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  50 
 
 		 200 aa  227  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  46.5 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  50 
 
 		 200 aa  217  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  48.5 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  49.5 
 
 		 200 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  48 
 
 		 202 aa  207  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  45 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  44 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  39.3 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2657  nitroreductase  43.28 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.752481  normal  0.637011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  39.5 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  39 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3079  nitroreductase family protein  39.5 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  39 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1699  nitroreductase  37.19 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4241  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4079  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0494988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4090  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4571  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4463  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.325624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4422  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0774  nitroreductase family protein  31.66 
 
 		 208 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.139157 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0154  putative nitroreductase  32 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2948  nitroreductase  32.78 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.5003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1970  nitroreductase  34.08 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1024  nitroreductase  33.51 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  32.61 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3107  nitroreductase  27.86 
 
 		 211 aa  97.1  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  28.11 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5169  nitroreductase  28.79 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.62 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  31.32 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2158  NAD(P)H nitroreductase  30 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3952  nitroreductase  27.5 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0851769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  27.27 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4154  nitroreductase family protein  28.18 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1084  nitroreductase family protein  28.18 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.12 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4065  nitroreductase family protein  27.62 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3955  nitroreductase family protein  27.62 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3801  nitroreductase family protein  27.62 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4264  nitroreductase family protein  27.62 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  27.87 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4824  NADH dehydrogenase  28.02 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  27.17 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4112  nitroreductase family protein  27.07 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3786  nitroreductase family protein  27.07 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.776099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4176  nitroreductase family protein  27.07 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8440  nitroreductase  28.73 
 
 		 205 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  26.88 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  30.18 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2744  nitroreductase  26.09 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.613458  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  27.72 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  25.51 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  25.51 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  29 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  25.51 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  25.51 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  25.51 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  25.51 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  25 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  25.54 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  28.43 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  27.51 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  29.26 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  27.32 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.21 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3874  nitroreductase  27.72 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1731  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.89 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.178884  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0456  nitroreductase  25.74 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  24.58 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.29 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  25.73 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  26.5 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  27.59 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  24.64 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05892  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  25.36 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  24.77 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  25.13 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  24.64 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  28 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  25.79 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  25.86 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  24.88 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.18 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  24.88 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  24.34 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  23.37 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.88 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  23.88 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.15 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  25.29 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  26.49 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  24.17 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  27.01 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2070  hypothetical protein  28.41 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237488  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  25.29 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  24.21 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  27.11 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>