More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2639 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  57.04 
 
 		 290 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  56.31 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  58.74 
 
 		 299 aa  322  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  57 
 
 		 301 aa  322  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  56.23 
 
 		 291 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  46.46 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  46.88 
 
 		 292 aa  285  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  45.67 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  44.1 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  41.89 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  46.76 
 
 		 299 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  38.83 
 
 		 287 aa  231  9e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  41.5 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  43.49 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  39.06 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  44.07 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_3962  fructokinase  37 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  35.33 
 
 		 347 aa  168  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  36.7 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
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NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  39.86 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  30.11 
 
 		 764 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.18 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.18 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  28.53 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.17 
 
 		 410 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.23 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  26.69 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.74 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.23 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.64 
 
 		 414 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.92 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  28.97 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.97 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  28.82 
 
 		 323 aa  86.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  35 
 
 		 363 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  27.97 
 
 		 321 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  29.28 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  28.05 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  27.19 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  28.92 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.34 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  26.14 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.88 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  29.48 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  28.11 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  28.11 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  27.33 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  26.69 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
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NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  28.11 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  28.66 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.71 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  28.57 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  26.83 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  28.03 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  31.71 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  33.5 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  29.22 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.13 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  29.65 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  30.61 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  27.64 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  27.86 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  28.57 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.79 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  34.32 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  27.24 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  26.36 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  32.16 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6585  ROK family protein  30.48 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  25.88 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  31.6 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  24.52 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.79 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  25 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  38.97 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  32.12 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.36 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  26.97 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  29.9 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  27.51 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  30.38 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  30.43 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0003  glucokinase  30.34 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000615827  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  22.69 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  27.22 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  30.15 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  27.68 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008532  STER_0770  glucose kinase  30.53 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  27.72 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.36 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.78 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.45 
 
 		 408 aa  72.4  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  30.36 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
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NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  27.16 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
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NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  28 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
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NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  27.01 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_2265  ROK  28.69 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  27.24 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  29.31 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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