168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0111 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  681    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  92.62 
 
 		 325 aa  634    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  97.85 
 
 		 325 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  96.31 
 
 		 325 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  79.94 
 
 		 325 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  79.32 
 
 		 325 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  79.63 
 
 		 325 aa  551  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  78.4 
 
 		 325 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  72 
 
 		 325 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  61.92 
 
 		 323 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  54.94 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  54.94 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  54.01 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  53.7 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  53.4 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  54.32 
 
 		 327 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  82.61 
 
 		 208 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  58.68 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3091  hypothetical protein  56.55 
 
 		 326 aa  358  8e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0496594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  59.03 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  59.03 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0196  hypothetical protein  58.68 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2307  hypothetical protein  55.91 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1948  hypothetical protein  57.24 
 
 		 326 aa  352  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.270103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2653  hypothetical protein  58.68 
 
 		 326 aa  352  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  54.64 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  55.59 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  55.3 
 
 		 325 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0052  hypothetical protein  55.27 
 
 		 326 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.186799 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  57.29 
 
 		 325 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  50.62 
 
 		 327 aa  348  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  54.64 
 
 		 316 aa  348  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  56.94 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2299  hypothetical protein  56.94 
 
 		 325 aa  347  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.187044  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  55.9 
 
 		 325 aa  346  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2628  hypothetical protein  54.31 
 
 		 326 aa  346  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  56.6 
 
 		 325 aa  345  6e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4465  hypothetical protein  56.25 
 
 		 325 aa  345  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2785  hypothetical protein  56.9 
 
 		 325 aa  345  8e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0143634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3087  hypothetical protein  56.94 
 
 		 325 aa  345  8e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0115  hypothetical protein  56.6 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  55.9 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2922  hypothetical protein  55.7 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  56.6 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  55.9 
 
 		 325 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1241  hypothetical protein  56.6 
 
 		 325 aa  341  9e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  55.21 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  55.21 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4547  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2814  hypothetical protein  55.9 
 
 		 325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0606  hypothetical protein  56.6 
 
 		 325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2958  hypothetical protein  55.21 
 
 		 325 aa  338  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  55.21 
 
 		 325 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  55.9 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1610  hypothetical protein  55.56 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3084  hypothetical protein  56.25 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1546  hypothetical protein  55.21 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1378  hypothetical protein  54.51 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  54.83 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3773  hypothetical protein  54.14 
 
 		 325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.149988  hitchhiker  0.00126811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3681  hypothetical protein  55.52 
 
 		 323 aa  335  5e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  54.39 
 
 		 319 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4299  hypothetical protein  54.17 
 
 		 325 aa  332  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4749  hypothetical protein  53.82 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.291957  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2533  hypothetical protein  56.38 
 
 		 326 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0991372  normal  0.0595118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3627  hypothetical protein  53.82 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  54.45 
 
 		 329 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2414  hypothetical protein  52.62 
 
 		 326 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  45.56 
 
 		 370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  48.06 
 
 		 341 aa  308  8e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  49 
 
 		 329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  46.35 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  44.94 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  61.07 
 
 		 271 aa  301  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  47.12 
 
 		 341 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  45.89 
 
 		 347 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  46.79 
 
 		 341 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  45.83 
 
 		 341 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  50.95 
 
 		 336 aa  298  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  55.73 
 
 		 293 aa  297  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  45.51 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  46.47 
 
 		 345 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  45.4 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1945  protein of unknown function DUF1568  45.19 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  44.13 
 
 		 344 aa  291  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  44.62 
 
 		 344 aa  291  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  45.08 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  43.31 
 
 		 345 aa  288  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  48.97 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02418  hypothetical protein  44.94 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  43.81 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  44.67 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  46.15 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  40.29 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  51.42 
 
 		 213 aa  238  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  57.29 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3041  hypothetical protein  58.33 
 
 		 198 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3446  hypothetical protein  58.33 
 
 		 198 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3682  hypothetical protein  59.55 
 
 		 198 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>