69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0776 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0776  glycoside hydrolase family 24  100 
 
 
174 aa  357  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180108  normal  0.254443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0780  glycoside hydrolase family protein  96.55 
 
 
177 aa  348  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0749  glycoside hydrolase family protein  95.98 
 
 
174 aa  345  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.719939  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3605  glycoside hydrolase family protein  94.25 
 
 
177 aa  339  9e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0767581  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2129  glycoside hydrolase family protein  51.4 
 
 
188 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.471156  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2082  glycoside hydrolase family protein  50.84 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0227839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0659  lysozyme, putative  49.72 
 
 
185 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3256  glycoside hydrolase family protein  52.05 
 
 
159 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0715149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  49.11 
 
 
163 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1671  glycoside hydrolase family protein  46.2 
 
 
155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1392  glycoside hydrolase family protein  40.12 
 
 
157 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9576  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0629  phage lysozyme  32.14 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194528  decreased coverage  0.000000266391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01975  hypothetical protein  34.97 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0394  phage lysozyme  30.95 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.684429  decreased coverage  0.00000000000000176346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00513  hypothetical protein  35.38 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.770196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00507  predicted lysozyme  35.38 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.69492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3074  Lysozyme  34.62 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0827  phage lysozyme  35.38 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.99177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2900  phage lysozyme  35.38 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.58341  hitchhiker  0.0000000713415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0892  phage lysozyme  35.38 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2648  Lysozyme  31.76 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.010454  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1920  hypothetical protein  33.82 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1797  glycoside hydrolase family protein  33.59 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3886  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.047713  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  32.82 
 
 
341 aa  61.6  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  33.82 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  33.82 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  29.32 
 
 
142 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2180  lysozyme  29.33 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1695  hypothetical protein  28.65 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1305  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 
136 aa  55.1  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.340031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2642  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 
196 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118674  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  31.62 
 
 
150 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  31.62 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  32.33 
 
 
143 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4670  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  0.812257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1185  glycoside hydrolase family 24  28.48 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  29.58 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0795  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.509528  normal  0.0116417 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  30.08 
 
 
143 aa  51.2  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3296  prophage LambdaSo, lysozyme, putative  25.77 
 
 
170 aa  50.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938297  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2770  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.206287  decreased coverage  0.0000183318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2861  phage lysozyme  29.22 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  29.93 
 
 
148 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  29.93 
 
 
148 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3043  phage lysozyme  28.76 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3421  prophage LambdaMc01, lysozyme  33.09 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3494  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0931  phage lysozyme  28.76 
 
 
170 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1729  putative endolysin (lysis protein) (lysozyme)  25.93 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.171325  normal  0.0114013 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 
178 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  27.46 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  30.34 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1388  lysozyme, phage-related lysozyme  23.03 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000577391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2612  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
182 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0934959  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4180  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.62 
 
 
414 aa  44.3  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2287  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2090  Lysozyme  32.17 
 
 
177 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00497326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2083  lysozyme  32.17 
 
 
177 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2309  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2680  prophage LambdaMc01, lysozyme  29.01 
 
 
152 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4372  glycoside hydrolase, family 24  27.01 
 
 
169 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000000130314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1445  glycoside hydrolase family protein  36.05 
 
 
184 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  31.31 
 
 
186 aa  41.2  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0871  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718049  normal  0.102143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0883  putative lysozyme (endolysin) protein  28.4 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3178  glycoside hydrolase family 24  25.33 
 
 
169 aa  40.8  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>