More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0915 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01883  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  98.67 
 
 
452 aa  907    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000273191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1683  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.45 
 
 
452 aa  905    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2199  heavy metal sensor histidine kinase  99.34 
 
 
452 aa  913    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01873  hypothetical protein  98.67 
 
 
452 aa  907    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000189435  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1217  heavy metal sensor histidine kinase  99.12 
 
 
452 aa  910    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00057319  normal  0.58155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2069  heavy metal sensor histidine kinase  99.56 
 
 
452 aa  915    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0915  heavy metal sensor histidine kinase  100 
 
 
452 aa  920    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000246705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1677  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.01 
 
 
452 aa  900    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00542699  normal  0.137628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2747  heavy metal sensor histidine kinase  98.01 
 
 
452 aa  902    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000765675  normal  0.226821 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  55.56 
 
 
454 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  55.56 
 
 
454 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  55.33 
 
 
454 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  55.33 
 
 
454 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  55.11 
 
 
454 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  33.19 
 
 
467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.07 
 
 
471 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  33.81 
 
 
463 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  33.09 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
480 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
481 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
480 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  34.96 
 
 
462 aa  206  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
465 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  33.86 
 
 
462 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
462 aa  202  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
466 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  31.1 
 
 
476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  30.16 
 
 
466 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
477 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
467 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
472 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
467 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  30.41 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  30.15 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
469 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  33.64 
 
 
463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
471 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
489 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  36.21 
 
 
475 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  26.29 
 
 
462 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
461 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
456 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
471 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 
468 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
456 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
450 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
493 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
447 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
462 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
465 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
449 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
467 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
465 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
462 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
467 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  30.56 
 
 
431 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
481 aa  170  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  28.54 
 
 
459 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
477 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  31.48 
 
 
486 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
465 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
450 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
458 aa  167  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.17 
 
 
446 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.21 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  29.41 
 
 
464 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  29.41 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  29.41 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  29.41 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  29.41 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  29.41 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  34.41 
 
 
463 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>