More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2611 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
354 aa  727    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
354 aa  727    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.84 
 
 
354 aa  582  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.91 
 
 
348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.28 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.77 
 
 
361 aa  282  7.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  43.24 
 
 
339 aa  280  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  39.83 
 
 
361 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  41.88 
 
 
356 aa  271  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  42.32 
 
 
349 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.94 
 
 
362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 
344 aa  265  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.09 
 
 
362 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  37.64 
 
 
367 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  37.92 
 
 
363 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.28 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.47 
 
 
343 aa  259  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.51 
 
 
348 aa  258  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.27 
 
 
363 aa  258  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.18 
 
 
344 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  38.2 
 
 
355 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.78 
 
 
362 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.14 
 
 
352 aa  255  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.44 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 
355 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.11 
 
 
363 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.34 
 
 
352 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  37.12 
 
 
357 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 
364 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.17 
 
 
376 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.41 
 
 
340 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.72 
 
 
364 aa  245  9e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.76 
 
 
378 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.71 
 
 
354 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.6 
 
 
356 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.4 
 
 
364 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  37.87 
 
 
364 aa  242  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  36.8 
 
 
356 aa  242  7e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.3 
 
 
340 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 
364 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  38.24 
 
 
363 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  38.24 
 
 
363 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.12 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  40 
 
 
356 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.59 
 
 
335 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.28 
 
 
364 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.08 
 
 
351 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.29 
 
 
364 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.29 
 
 
364 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.44 
 
 
364 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.22 
 
 
364 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.84 
 
 
344 aa  238  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  38.08 
 
 
340 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.44 
 
 
337 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  36.8 
 
 
356 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.88 
 
 
363 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.37 
 
 
356 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.37 
 
 
356 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.97 
 
 
362 aa  236  4e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.28 
 
 
377 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.32 
 
 
344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  38.78 
 
 
348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  36 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.12 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.4 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  38.19 
 
 
342 aa  233  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.4 
 
 
339 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.4 
 
 
339 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.79 
 
 
345 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.16 
 
 
350 aa  233  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.1 
 
 
339 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.06 
 
 
358 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.64 
 
 
347 aa  232  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.64 
 
 
347 aa  232  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.92 
 
 
377 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.5 
 
 
345 aa  232  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.81 
 
 
339 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.03 
 
 
358 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  38.01 
 
 
344 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.1 
 
 
339 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.1 
 
 
339 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.31 
 
 
355 aa  231  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.69 
 
 
344 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.77 
 
 
358 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.36 
 
 
340 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.29 
 
 
339 aa  230  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.87 
 
 
356 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.67 
 
 
357 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.81 
 
 
339 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.08 
 
 
352 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.5 
 
 
354 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.52 
 
 
358 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.13 
 
 
377 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.51 
 
 
336 aa  229  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.51 
 
 
336 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.51 
 
 
336 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.2 
 
 
352 aa  229  7e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.47 
 
 
353 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>