More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0435 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
193 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
193 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  62.18 
 
 
196 aa  248  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  28.43 
 
 
201 aa  85.1  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  25.51 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  31.82 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  31.25 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
195 aa  72  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  25 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  26.94 
 
 
205 aa  72  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
452 aa  71.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
221 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  29.06 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  28.65 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  23.29 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  26.9 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  25.91 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.98 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 
436 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  26.4 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48292  phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  24.87 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  27.98 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.41 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
449 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  26.39 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  27.6 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  26.09 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  27.64 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  24.87 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  27.41 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
249 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  27.98 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
278 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  27.57 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.43 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  30.43 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  30.43 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  25.93 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
448 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  27.23 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>