More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1296 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  353  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  64.61 
 
 
180 aa  228  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  56.74 
 
 
173 aa  174  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  43.55 
 
 
192 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  46.32 
 
 
197 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  46.71 
 
 
200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  46.05 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  45.86 
 
 
185 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  46.05 
 
 
200 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  54.96 
 
 
197 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  42.93 
 
 
187 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  46.71 
 
 
200 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  40.66 
 
 
186 aa  121  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  45.62 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  44.72 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  43.72 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  45 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  41.62 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  44.26 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  43.51 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  45.28 
 
 
187 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  41.3 
 
 
187 aa  119  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  40.76 
 
 
187 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  40.76 
 
 
187 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  44.3 
 
 
193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  40.22 
 
 
187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  50.39 
 
 
193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  50 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  57.48 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  37.5 
 
 
185 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  38.92 
 
 
186 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  37.3 
 
 
184 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  41.76 
 
 
184 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.88 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.88 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.88 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  47.17 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  43.21 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  48.03 
 
 
189 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  44.23 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  43.17 
 
 
196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  44.37 
 
 
200 aa  111  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  40.66 
 
 
184 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  40.98 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  48.8 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  40.66 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  35.87 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  37.76 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  42.08 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  50.39 
 
 
182 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  47.83 
 
 
189 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  41.18 
 
 
192 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.67 
 
 
199 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  38.46 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  40.48 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  40.48 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  59.63 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  45.03 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  39.25 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  59.63 
 
 
175 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  45.59 
 
 
189 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  43.29 
 
 
189 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.25 
 
 
206 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  59.63 
 
 
175 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  47.86 
 
 
185 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  47.86 
 
 
185 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  42.38 
 
 
194 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  43.23 
 
 
191 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  43.04 
 
 
228 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  31.28 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  38.89 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  39.08 
 
 
187 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  37.97 
 
 
180 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  38.89 
 
 
188 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  38.89 
 
 
188 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  38.89 
 
 
188 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  46.67 
 
 
184 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  38.89 
 
 
188 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  38.89 
 
 
188 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  43.04 
 
 
208 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  38.89 
 
 
188 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  51.59 
 
 
186 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  41.27 
 
 
188 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.91 
 
 
198 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  41.06 
 
 
196 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  46.41 
 
 
189 aa  106  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  41.71 
 
 
184 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  44.02 
 
 
185 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  36.96 
 
 
186 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  45.1 
 
 
183 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  40.48 
 
 
188 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  38.61 
 
 
207 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  40.52 
 
 
179 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.26 
 
 
198 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.37 
 
 
191 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.37 
 
 
191 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  39.78 
 
 
184 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  40.54 
 
 
198 aa  104  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  45.28 
 
 
189 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  55.2 
 
 
187 aa  104  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>