More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1054 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  61.19 
 
 		 564 aa  656    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  100 
 
 		 576 aa  1170    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  61.38 
 
 		 569 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  48.28 
 
 		 564 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  47.66 
 
 		 573 aa  505  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  45.44 
 
 		 573 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  45.91 
 
 		 569 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  36.33 
 
 		 608 aa  343  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  35.65 
 
 		 613 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  37.82 
 
 		 569 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  36.89 
 
 		 560 aa  296  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 596 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  35.44 
 
 		 543 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  36.4 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  36.38 
 
 		 537 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  36.76 
 
 		 535 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  35.05 
 
 		 542 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  34.68 
 
 		 565 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  35.32 
 
 		 575 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  35.6 
 
 		 542 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.18 
 
 		 574 aa  250  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  35.21 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.98 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  33.08 
 
 		 544 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  32.9 
 
 		 616 aa  233  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 529 aa  233  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  34.03 
 
 		 538 aa  229  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  32.26 
 
 		 541 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.87 
 
 		 584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.81 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  32.52 
 
 		 603 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.91 
 
 		 583 aa  214  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.05 
 
 		 553 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  31.92 
 
 		 601 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  29.77 
 
 		 585 aa  207  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.53 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.33 
 
 		 583 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  30.89 
 
 		 582 aa  204  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  31.02 
 
 		 580 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.39 
 
 		 564 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.09 
 
 		 530 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.84 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.72 
 
 		 550 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.9 
 
 		 544 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.47 
 
 		 545 aa  197  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  31.18 
 
 		 527 aa  196  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 565 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  30.87 
 
 		 580 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.9 
 
 		 557 aa  193  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  30.55 
 
 		 589 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  31.13 
 
 		 547 aa  186  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.19 
 
 		 565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  31.42 
 
 		 606 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.63 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  28.85 
 
 		 580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32.56 
 
 		 620 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 548 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 548 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 548 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  28.12 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 579 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 533 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.71 
 
 		 556 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  29.66 
 
 		 576 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.26 
 
 		 539 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.84 
 
 		 522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.32 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  26.23 
 
 		 522 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.57 
 
 		 575 aa  173  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.57 
 
 		 575 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  26.37 
 
 		 583 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  28.4 
 
 		 563 aa  172  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  31.47 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.42 
 
 		 546 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 552 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  28.17 
 
 		 564 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 583 aa  171  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.75 
 
 		 543 aa  171  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 583 aa  171  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 		 549 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  26.2 
 
 		 583 aa  170  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.7 
 
 		 540 aa  169  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.44 
 
 		 527 aa  169  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.63 
 
 		 619 aa  169  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.95 
 
 		 522 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.02 
 
 		 544 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.85 
 
 		 522 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.66 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.04 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.17 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.04 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.8 
 
 		 558 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  27.69 
 
 		 563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 538 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.39 
 
 		 546 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>