298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0844 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  100 
 
 
539 aa  1101    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  41.88 
 
 
552 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  41.6 
 
 
544 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  39.62 
 
 
525 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  35.39 
 
 
578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  29.23 
 
 
526 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  25.33 
 
 
481 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  28.54 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  25.95 
 
 
481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  27.88 
 
 
525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  29.18 
 
 
471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  28.09 
 
 
468 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  26.44 
 
 
467 aa  128  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  28.73 
 
 
468 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  28.09 
 
 
468 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  28.51 
 
 
468 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  28 
 
 
468 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  29.32 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  28.06 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  27.86 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  26.81 
 
 
495 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  27.9 
 
 
497 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  25.92 
 
 
469 aa  118  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  26.68 
 
 
466 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  24.85 
 
 
472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  28.95 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  24.14 
 
 
477 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  27.69 
 
 
414 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  25.1 
 
 
471 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  25.4 
 
 
471 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  24.44 
 
 
469 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  27.43 
 
 
457 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  23.75 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  26.34 
 
 
454 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  25.89 
 
 
458 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  26.56 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  26.77 
 
 
580 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  37.69 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  40.16 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  41.84 
 
 
512 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  24.72 
 
 
460 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  39.84 
 
 
757 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  44.44 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  46.32 
 
 
548 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  36.72 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  32.58 
 
 
947 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  35.48 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  46.43 
 
 
725 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  24.02 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  45 
 
 
519 aa  74.3  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  40 
 
 
678 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  24.23 
 
 
463 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  49.41 
 
 
772 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  39.26 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  45 
 
 
518 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  31.11 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  41.18 
 
 
751 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  41.58 
 
 
743 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.91 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  47.44 
 
 
518 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.41 
 
 
466 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  43.14 
 
 
535 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  29.33 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  43.14 
 
 
536 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  40.83 
 
 
500 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  43.68 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  28.46 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  43.68 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  27.43 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  43.68 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  29.58 
 
 
815 aa  67.8  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  27.06 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  39.81 
 
 
502 aa  67.4  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  37.5 
 
 
559 aa  67.4  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  42.68 
 
 
794 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  28.57 
 
 
466 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  42.53 
 
 
417 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  32.77 
 
 
533 aa  67  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  43.68 
 
 
417 aa  67  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  43.68 
 
 
417 aa  67  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  48.72 
 
 
512 aa  67  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  42.5 
 
 
313 aa  67  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  34.16 
 
 
515 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  32.03 
 
 
558 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  32.03 
 
 
558 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  42.53 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  50.77 
 
 
555 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  29.86 
 
 
502 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  26.07 
 
 
465 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  27.35 
 
 
466 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  27.17 
 
 
466 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 
534 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  28.16 
 
 
466 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  45.57 
 
 
1131 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  27.17 
 
 
466 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  43.48 
 
 
488 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  31.91 
 
 
542 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  29.53 
 
 
547 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  40.38 
 
 
506 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  44.44 
 
 
501 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>