254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4797 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4797  GatB/YqeY domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  279  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4355  GatB/Yqey domain-containing protein  90.67 
 
 
151 aa  184  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0459  GatB/YqeY domain protein  57.33 
 
 
154 aa  153  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.791017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9015  hypothetical protein  60 
 
 
150 aa  153  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551412  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4276  hypothetical protein  59.6 
 
 
152 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0942523  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5306  hypothetical protein  55.63 
 
 
151 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25460  hypothetical protein  58 
 
 
150 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  55.63 
 
 
151 aa  148  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0108  hypothetical protein  54 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.229292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0510  hypothetical protein  61.74 
 
 
150 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0338  hypothetical protein  56.67 
 
 
152 aa  136  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0107675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0593  hypothetical protein  56.95 
 
 
151 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0234  GatB/YqeY domain protein  56.21 
 
 
155 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.734136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0325  GatB/Yqey domain-containing protein  57.62 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0535  hypothetical protein  52.98 
 
 
150 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.46212  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4920  YqeY family protein  57.72 
 
 
155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0431  GatB/Yqey domain protein  54.67 
 
 
155 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.577475  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2005  GatB/Yqey domain-containing protein  52.29 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4563  GatB/YqeY  52.29 
 
 
160 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13719  hypothetical protein  43.51 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5224  GatB/Yqey domain-containing protein  46.75 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0543507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4856  hypothetical protein  46.75 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4945  GatB/Yqey domain-containing protein  46.75 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1860  hypothetical protein  47.06 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  41.61 
 
 
151 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18460  hypothetical protein  47.65 
 
 
152 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  43.54 
 
 
146 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  35.33 
 
 
148 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  41.06 
 
 
149 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
149 aa  101  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  100  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  41.5 
 
 
146 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  41.5 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  42.28 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  40.14 
 
 
149 aa  99  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  42.18 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  36.49 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  36.05 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  39.46 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  41.5 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  42.86 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  41.33 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  42.95 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  33.78 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  42.18 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  40.27 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  36.36 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  40.14 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  38.78 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  39.46 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  38.1 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  33.11 
 
 
147 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  41.1 
 
 
147 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  42.28 
 
 
149 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  33.11 
 
 
147 aa  94  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3960  hypothetical protein  45.83 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1043  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1712  GatB/Yqey family protein  34.01 
 
 
146 aa  92  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  34.9 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1043  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0747806  normal  0.521026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  42.18 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  39.6 
 
 
148 aa  91.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  35.37 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  36.49 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  41.61 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  35.14 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1015  GatB/Yqey family protein  32.86 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0682123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  40.71 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2279  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1994  GatB/Yqey domain-containing protein  36.24 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2131  GatB/Yqey domain-containing protein  35.53 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.321866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  37.09 
 
 
150 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  40.94 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  35.76 
 
 
149 aa  89  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2660  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000150328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  35.14 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0933  conserved hypothetical protein, GatB/YqeY family  35.14 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.346225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  38.78 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  36.05 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0104  hypothetical protein  36.67 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.716989 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3940  GatB/YqeY domain protein  38.16 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.147795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  36.91 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  36.05 
 
 
147 aa  87  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  36.49 
 
 
513 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  36.67 
 
 
151 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  32.45 
 
 
149 aa  87  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  40.27 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  38 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  38.78 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  36 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  35.14 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  37.33 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  38.51 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>