39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2110 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  88.46 
 
 		 550 aa  434  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  58.97 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  47.66 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  44.34 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  46.58 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  40.44 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  41.51 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  41.23 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  42.06 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  39.73 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  38.86 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  35.24 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  38.53 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  40 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  37.34 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  39.57 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  39.32 
 
 		 247 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  39.8 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  36.32 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  30.32 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  31.75 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  34.35 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  28.64 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  29.6 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  26.82 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  31.01 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  32.09 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  26.46 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2024  DNA alkylation repair enzyme  24.05 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  27.53 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  27.53 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  27.53 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  24.55 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  29.65 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  32.29 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  26.15 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  26.79 
 
 		 225 aa  42  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>