108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0661 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0661  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
244 aa  490  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0714  protein tyrosine/serine phosphatase  82.64 
 
 
253 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  65.5 
 
 
234 aa  288  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  36.21 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1917  protein tyrosine/serine phosphatase  37.3 
 
 
258 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.465769  normal  0.598754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  34.02 
 
 
249 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  41.97 
 
 
250 aa  99  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3057  protein tyrosine/serine phosphatase  32.34 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3262  protein tyrosine/serine phosphatase  32.37 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1584  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  33.71 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  29.48 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  28.81 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  32.24 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  30.95 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  30.93 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  32.8 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  21.46 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  31.6 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  30.39 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  27.03 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  32.5 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  29.37 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  28.78 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  29.55 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  31.72 
 
 
283 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 
266 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  32.78 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  29.92 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  29.85 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  32.09 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  29.94 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  26.59 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  32.8 
 
 
266 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  32.8 
 
 
266 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  32.8 
 
 
266 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  24.9 
 
 
274 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  30.8 
 
 
254 aa  58.9  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  30.37 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 
316 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  31.86 
 
 
315 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  24.39 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  29.28 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
289 aa  55.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  29.79 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  25.89 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  31.4 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  32.56 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  22.96 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  27.72 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  29.73 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  23.44 
 
 
289 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  29.79 
 
 
345 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  25.88 
 
 
256 aa  52  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  26.84 
 
 
339 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  31.02 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  31.98 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  29.78 
 
 
306 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  25.54 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  29.83 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  29.7 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  31.21 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4846  protein tyrosine/serine phosphatase  29.64 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  33.72 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  29.69 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  25.75 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09355  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 
278 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.0103312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  53.66 
 
 
299 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  24.32 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45376  predicted protein  43.86 
 
 
490 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.88052  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  27.73 
 
 
671 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  25.95 
 
 
263 aa  47  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  30.34 
 
 
260 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  28.81 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  30.64 
 
 
265 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  29.48 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  32.98 
 
 
280 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  29.95 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0178  protein tyrosine/serine phosphatase  29.46 
 
 
395 aa  45.8  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  30.34 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  32.24 
 
 
265 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  26.88 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  27.34 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  30.81 
 
 
280 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  32.43 
 
 
274 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  26.34 
 
 
269 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  24.78 
 
 
292 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  27.66 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  30.32 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  29.05 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  29.12 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  29.12 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  25.41 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  47.73 
 
 
637 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>