128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0939 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  62.65 
 
 		 515 aa  680    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  69.05 
 
 		 507 aa  738    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  66.6 
 
 		 511 aa  730    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  65.42 
 
 		 510 aa  720    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  100 
 
 		 507 aa  1052    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  54.53 
 
 		 508 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  53.72 
 
 		 508 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  53.52 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  56.09 
 
 		 507 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  56.7 
 
 		 508 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  55.43 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  45.29 
 
 		 537 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  44.31 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  44.31 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  42.74 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  44.11 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  42.86 
 
 		 526 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  40.08 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  41.63 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  40.72 
 
 		 524 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  38.97 
 
 		 522 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  41.11 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  40.69 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  39.22 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  41.39 
 
 		 527 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  40 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  36.99 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  39.06 
 
 		 524 aa  361  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  38.64 
 
 		 537 aa  361  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  37.63 
 
 		 528 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  36.27 
 
 		 517 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  38.66 
 
 		 518 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  37.06 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  36.42 
 
 		 525 aa  350  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  37.4 
 
 		 543 aa  348  9e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  37.6 
 
 		 543 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  37.02 
 
 		 517 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  38.02 
 
 		 522 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  36.98 
 
 		 543 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  37.6 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  38.01 
 
 		 520 aa  336  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  35.67 
 
 		 531 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.53 
 
 		 529 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.32 
 
 		 529 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  35.14 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  35.14 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  34.94 
 
 		 538 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 538 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.71 
 
 		 538 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  32.51 
 
 		 538 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.74 
 
 		 508 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  33.14 
 
 		 537 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  32.54 
 
 		 508 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  32.02 
 
 		 505 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 507 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  34.05 
 
 		 501 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  34.82 
 
 		 501 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  35.93 
 
 		 502 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  34.5 
 
 		 499 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  33.55 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  35.08 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  34.3 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  34.3 
 
 		 499 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  34.3 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  35.58 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  35.61 
 
 		 506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  36.36 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  35.27 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  35.88 
 
 		 504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  35.56 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  35.1 
 
 		 501 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  36.99 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  33.59 
 
 		 501 aa  236  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  35.64 
 
 		 506 aa  236  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  33.01 
 
 		 502 aa  236  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  34.7 
 
 		 497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  34.88 
 
 		 502 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  35.13 
 
 		 494 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  34.89 
 
 		 740 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  34.11 
 
 		 509 aa  233  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  34.41 
 
 		 503 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  35.91 
 
 		 498 aa  233  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  33.68 
 
 		 501 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  35.99 
 
 		 496 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  34.32 
 
 		 496 aa  229  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  34.26 
 
 		 506 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  34.29 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  32.68 
 
 		 510 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  33.85 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  35.17 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  33.33 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  34.88 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  33.83 
 
 		 503 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  34.98 
 
 		 504 aa  227  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  33.62 
 
 		 503 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  30.71 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>