131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0498 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  617  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  65.99 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  64.65 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  64.65 
 
 		 324 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  64.65 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.65 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  65.32 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  65.32 
 
 		 329 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  65.66 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  62.96 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  63.33 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  61.39 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  60.4 
 
 		 322 aa  358  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  46.45 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  33 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  34.81 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  31.51 
 
 		 312 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  33.22 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  34.59 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  35.05 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  33.76 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  34.08 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  30.67 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  33.9 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  32.8 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  31.21 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  31.21 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  31.21 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  29.57 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  30.32 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  28.73 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  30.13 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  30.13 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  30.13 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  30.13 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  30.13 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  30.13 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  28.73 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  28.73 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  28.73 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  28.73 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  30.13 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  29.71 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  27.36 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  26.45 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  30.9 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  26.47 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  30.34 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  26.1 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  22.45 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.28 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  26.29 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  26.29 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  27.95 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.89 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  29.78 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  22.73 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  25.52 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  29.14 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  29.08 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  27.42 
 
 		 512 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.29 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  24.9 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  24.38 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  24.07 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  24.07 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  24.07 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  25.67 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  25.67 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  27.08 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  24.07 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  23.22 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  24.07 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  24.07 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  23.65 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  29.1 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  29.1 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  29.1 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  26.48 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  29.1 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  29.1 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  24.32 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  24.72 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  24.51 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  22.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  28.17 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  24.07 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.45 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  28.92 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  24.28 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0499  hypothetical protein  26.9 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>