More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0284 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  59.17 
 
 
1032 aa  1274    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.43 
 
 
1034 aa  802    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  100 
 
 
1031 aa  2117    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  34.28 
 
 
1084 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  32.37 
 
 
1087 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  36.54 
 
 
1064 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  36.54 
 
 
1064 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
1068 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  36.15 
 
 
1064 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  36.15 
 
 
1064 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  35.97 
 
 
1064 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  36.15 
 
 
1064 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  35.89 
 
 
1064 aa  446  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  35.32 
 
 
1064 aa  446  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  38.34 
 
 
1066 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  35.19 
 
 
1064 aa  439  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 
1082 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  31.06 
 
 
1077 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
1112 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.83 
 
 
1125 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  35.13 
 
 
1084 aa  396  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  35.13 
 
 
1084 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 
1069 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 
1139 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  32.7 
 
 
1069 aa  376  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  32.9 
 
 
1069 aa  373  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  42.09 
 
 
1181 aa  360  8e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.77 
 
 
1102 aa  356  1e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  36.04 
 
 
1082 aa  353  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.33 
 
 
977 aa  343  9e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  34.79 
 
 
1394 aa  343  1e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 
1104 aa  340  7e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 
1089 aa  338  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  41.62 
 
 
1150 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  33.7 
 
 
1062 aa  335  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  38.52 
 
 
1362 aa  335  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  39.17 
 
 
1086 aa  335  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 
1155 aa  332  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  33.55 
 
 
1031 aa  332  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  40.37 
 
 
1386 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  38.81 
 
 
1134 aa  332  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
918 aa  332  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  39.82 
 
 
876 aa  331  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  39.96 
 
 
1250 aa  330  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 
982 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  40.12 
 
 
991 aa  330  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  40 
 
 
918 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.69 
 
 
1129 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  38.02 
 
 
1071 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  37.8 
 
 
1068 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 
1118 aa  328  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  39.84 
 
 
918 aa  328  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  40 
 
 
918 aa  327  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  40 
 
 
918 aa  327  6e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  40 
 
 
918 aa  327  6e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  39.8 
 
 
1070 aa  327  7e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  39.8 
 
 
918 aa  327  9e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
1055 aa  326  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  41.96 
 
 
1108 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  41.09 
 
 
1073 aa  327  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  39.48 
 
 
918 aa  326  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  40.12 
 
 
1178 aa  326  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.41 
 
 
1068 aa  326  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  39.72 
 
 
918 aa  327  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  39.8 
 
 
918 aa  326  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 
1073 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  41.09 
 
 
1082 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  41.3 
 
 
1082 aa  325  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
1068 aa  325  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.7 
 
 
1091 aa  324  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 
1069 aa  324  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  41.95 
 
 
1088 aa  323  8e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  41 
 
 
1073 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  39.32 
 
 
1130 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  40 
 
 
918 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.76 
 
 
1068 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  40.67 
 
 
1088 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  41.09 
 
 
1082 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  41.76 
 
 
1209 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  40.13 
 
 
1120 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  40.56 
 
 
1127 aa  321  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  41.53 
 
 
1088 aa  321  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
1403 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  40.92 
 
 
1073 aa  320  9e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  40.77 
 
 
964 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  40.84 
 
 
914 aa  320  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 
1073 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 
1091 aa  319  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  40.12 
 
 
872 aa  318  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  40.84 
 
 
918 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.64 
 
 
1261 aa  318  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  40.65 
 
 
985 aa  317  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  40.33 
 
 
896 aa  317  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.32 
 
 
933 aa  317  9e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  39.56 
 
 
773 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 
1021 aa  316  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  39.96 
 
 
663 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  38.67 
 
 
1096 aa  314  4.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  40.09 
 
 
1284 aa  314  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  38.38 
 
 
959 aa  313  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>