More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0948 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0948  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
209 aa  420  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0793673  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0906  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  76.08 
 
 
209 aa  335  2.9999999999999997e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00296617  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0359  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.92 
 
 
215 aa  226  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000171313  hitchhiker  0.000153008 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  49.76 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0577  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  46.57 
 
 
212 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  46.01 
 
 
254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1666  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  47.55 
 
 
213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151936  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  45.67 
 
 
244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  46.15 
 
 
244 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  47.47 
 
 
268 aa  199  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.38 
 
 
240 aa  197  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0403  ABC transporter related  46.67 
 
 
245 aa  197  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4546  ABC transporter related  44.34 
 
 
254 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1533  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 
230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0016393  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6373  ABC transporter related  44.08 
 
 
254 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535484  normal  0.530942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 
240 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.5 
 
 
255 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  44.34 
 
 
244 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
240 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  47.12 
 
 
254 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  44.93 
 
 
242 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  45.58 
 
 
247 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  47.12 
 
 
254 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1326  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 
224 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00202855  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  47.12 
 
 
242 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  45.89 
 
 
247 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 
240 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6258  ABC transporter related  44.65 
 
 
257 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000084841  normal  0.418068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  44.93 
 
 
244 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  47.62 
 
 
252 aa  191  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
242 aa  191  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  191  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  44.76 
 
 
240 aa  191  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  191  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  191  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  191  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  191  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
240 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  44.76 
 
 
240 aa  191  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  191  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  44.61 
 
 
251 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  45.24 
 
 
244 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  45.71 
 
 
247 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  45.19 
 
 
246 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00357  ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 
249 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  43.96 
 
 
244 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  45.28 
 
 
246 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
240 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0244  ABC transporter related  45.85 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0238  ABC transporter related  45.85 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  45.89 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.96 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  45.89 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
245 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4838  ABC transporter related  45.58 
 
 
260 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322693  normal  0.0389371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
254 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 
240 aa  188  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  43.96 
 
 
244 aa  188  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  50 
 
 
240 aa  188  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  43.48 
 
 
244 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
240 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  45.89 
 
 
252 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  44.44 
 
 
244 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
249 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  45.37 
 
 
242 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 
242 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  43.48 
 
 
267 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4859  ABC transporter related  43.19 
 
 
266 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.430729 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  43.48 
 
 
242 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  43.48 
 
 
250 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  43.48 
 
 
244 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  46.86 
 
 
242 aa  186  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001572  arginine ABC transporter ATP-binding protein ArtP  44.76 
 
 
242 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  44.61 
 
 
252 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  46.41 
 
 
255 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  45.05 
 
 
274 aa  185  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
240 aa  185  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 
244 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3583  ABC transporter related  44.93 
 
 
241 aa  185  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
240 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
240 aa  185  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  41.94 
 
 
258 aa  185  5e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_003296  RS05401  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.98 
 
 
244 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 
240 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  43.48 
 
 
244 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
240 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
240 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 
240 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2355  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 
242 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 
240 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>