286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2949 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2949  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
228 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5791  Uracil-DNA glycosylase superfamily  70.14 
 
 
233 aa  304  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3772  Uracil-DNA glycosylase superfamily  66.82 
 
 
226 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3631  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  67.45 
 
 
226 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3689  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  66.51 
 
 
226 aa  275  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1903  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.61 
 
 
312 aa  275  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0842  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62.39 
 
 
230 aa  258  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558809  normal  0.314333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5298  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.83 
 
 
240 aa  257  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32190  uracil-DNA glycosylase  61.04 
 
 
235 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.657779  normal  0.0875972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0440  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.63 
 
 
251 aa  255  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.09 
 
 
268 aa  255  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56795  hitchhiker  0.0037268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0899  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.76 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242395  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0925  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.91 
 
 
261 aa  252  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0935  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.65 
 
 
284 aa  251  8.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1651  Uracil-DNA glycosylase superfamily  59.15 
 
 
299 aa  247  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1028  Uracil-DNA glycosylase superfamily  60.44 
 
 
294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250169  normal  0.0211091 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11285  hypothetical protein  59.09 
 
 
299 aa  244  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5226  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.17 
 
 
244 aa  244  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1040  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.64 
 
 
301 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29970  uracil-DNA glycosylase  57.76 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8576  uracil-DNA glycosylase superfamily  59.47 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610367  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4459  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.31 
 
 
284 aa  241  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0682  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.22 
 
 
276 aa  238  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2636  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.14 
 
 
221 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.68 
 
 
282 aa  235  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1564  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.12 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  hitchhiker  0.00784209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3971  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.3 
 
 
273 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.649617  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3957  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.3 
 
 
273 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4031  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.3 
 
 
273 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0811  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.87 
 
 
262 aa  228  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0366  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.91 
 
 
217 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3233  Uracil-DNA glycosylase superfamily  61.75 
 
 
281 aa  223  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718462  normal  0.0819142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3919  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.56 
 
 
271 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1079  Uracil-DNA glycosylase superfamily  58.87 
 
 
291 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3164  Uracil-DNA glycosylase superfamily  53.67 
 
 
221 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.368387  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3755  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  65 
 
 
186 aa  215  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0169947  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1386  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.72 
 
 
236 aa  202  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0479897  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1921  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.45 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.21092 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0818  Uracil-DNA glycosylase superfamily  51.2 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0737592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1908  hypothetical protein  49.53 
 
 
218 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0736  putative uracil-DNA glycosylase  43.18 
 
 
224 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.93 
 
 
206 aa  168  7e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1361  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.04 
 
 
214 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.88 
 
 
225 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0136839  hitchhiker  0.00783391 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1599  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.04 
 
 
212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0814  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.72 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0720  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.59 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1220  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.33 
 
 
232 aa  161  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.58979  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2605  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.26 
 
 
200 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0477634  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2258  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.34 
 
 
242 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1269  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.16 
 
 
238 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0544  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.09 
 
 
219 aa  158  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2965  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.69 
 
 
224 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2632  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.09 
 
 
226 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122532  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2864  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.54 
 
 
223 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.48935  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0703  hypothetical protein  46.34 
 
 
207 aa  155  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.109523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2448  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.15 
 
 
236 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1001  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.49 
 
 
228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00625229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1551  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.24 
 
 
220 aa  149  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1925  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.39 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1579  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.29 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.111562  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1722  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.39 
 
 
225 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.598455  normal  0.212618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1860  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.44 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0361601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4690  putative uracil-DNA glycosylase  41.95 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3835  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.65 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0943  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.86 
 
 
220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0789384  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0527  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.09 
 
 
211 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0572467  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0642  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.12 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0648  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.12 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0380  Uracil-DNA glycosylase superfamily  39.82 
 
 
232 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.172992  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2639  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.63 
 
 
216 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.990849  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0466  uracil DNA glycosylase family protein  37.56 
 
 
228 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.276682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2037  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.8 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.161308  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0248  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.96 
 
 
192 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  0.366992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0318  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.61 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100378  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.12 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.52 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.48 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0119  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.35 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0183  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.97 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.589955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.71 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.95 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.809619 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.71 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.95 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.27 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.55 
 
 
186 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.95 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.32 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.58 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.73 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2071  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.44 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  30.39 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  31.28 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1948  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.7 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.735506  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0798  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.86 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.61 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.5 
 
 
200 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.68 
 
 
263 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.02 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  31.02 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>